Protein–RNA interactions for Protein: P28067

HLA-DMA, HLA class II histocompatibility antigen, DM alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-DMAP28067 NCKIPSD-204ENST00000416649 2925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
HLA-DMAP28067 IQCA1L-203ENST00000615129 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
HLA-DMAP28067 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
HLA-DMAP28067 MAGI1-201ENST00000330909 7415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
HLA-DMAP28067 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
HLA-DMAP28067 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
HLA-DMAP28067 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
HLA-DMAP28067 SLC25A21-AS1-201ENST00000556667 1924 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
HLA-DMAP28067 FOSL2-201ENST00000264716 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
HLA-DMAP28067 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
HLA-DMAP28067 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
HLA-DMAP28067 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC14.19□□□□□ -0.14
HLA-DMAP28067 PPP1R26-204ENST00000604351 4640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.19□□□□□ -0.14
HLA-DMAP28067 VARS2-201ENST00000321897 4073 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
HLA-DMAP28067 FAM149A-202ENST00000356371 2997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
HLA-DMAP28067 BRF1-211ENST00000547530 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
HLA-DMAP28067 ZMYM3-204ENST00000373982 1867 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
HLA-DMAP28067 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
HLA-DMAP28067 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
HLA-DMAP28067 PHYHD1-203ENST00000372592 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
HLA-DMAP28067 SLC30A5-209ENST00000621204 3999 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
HLA-DMAP28067 CAPN1-224ENST00000533129 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
HLA-DMAP28067 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
HLA-DMAP28067 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
HLA-DMAP28067 DBF4-201ENST00000265728 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
HLA-DMAP28067 CHL1-202ENST00000397491 5235 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
HLA-DMAP28067 PPP1R26P4-201ENST00000619065 3527 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
HLA-DMAP28067 PIK3IP1-201ENST00000215912 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
HLA-DMAP28067 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
HLA-DMAP28067 ZBTB17-202ENST00000375743 2745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
HLA-DMAP28067 FAM149B1-201ENST00000242505 5408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
HLA-DMAP28067 RCN2-203ENST00000394885 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
HLA-DMAP28067 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
HLA-DMAP28067 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC14.18□□□□□ -0.14
HLA-DMAP28067 C18orf25-206ENST00000619301 5264 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
HLA-DMAP28067 RCOR1-201ENST00000262241 5754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
HLA-DMAP28067 PARD3B-204ENST00000406610 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
HLA-DMAP28067 NFATC1-207ENST00000545796 3558 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
HLA-DMAP28067 RABIF-201ENST00000367262 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
HLA-DMAP28067 PTK7-210ENST00000471863 2412 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
HLA-DMAP28067 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
HLA-DMAP28067 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
HLA-DMAP28067 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC14.18□□□□□ -0.14
HLA-DMAP28067 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC14.18□□□□□ -0.14
HLA-DMAP28067 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
HLA-DMAP28067 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
HLA-DMAP28067 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
HLA-DMAP28067 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC14.18□□□□□ -0.14
HLA-DMAP28067 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
HLA-DMAP28067 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.18□□□□□ -0.14
HLA-DMAP28067 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
HLA-DMAP28067 CDC42-203ENST00000400259 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
HLA-DMAP28067 PRR23C-201ENST00000413199 2791 ntAPPRIS P1 BASIC14.18□□□□□ -0.14
HLA-DMAP28067 NTNG1-208ENST00000370074 3048 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
HLA-DMAP28067 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
HLA-DMAP28067 EIF3J-AS1-201ENST00000313807 2863 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
HLA-DMAP28067 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
HLA-DMAP28067 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
HLA-DMAP28067 CYB561-219ENST00000584031 3200 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
HLA-DMAP28067 RBPMS-201ENST00000287771 2974 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
HLA-DMAP28067 TK2-221ENST00000620035 5060 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
HLA-DMAP28067 RNASEH2B-202ENST00000422660 4830 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
HLA-DMAP28067 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
HLA-DMAP28067 HNF4G-201ENST00000354370 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
HLA-DMAP28067 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
HLA-DMAP28067 FSIP1-201ENST00000350221 2805 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
HLA-DMAP28067 MUM1-201ENST00000415183 2837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
HLA-DMAP28067 ZNF365-205ENST00000395254 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
HLA-DMAP28067 NKIRAS2-201ENST00000307641 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
HLA-DMAP28067 ABCC1-201ENST00000399408 6594 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
HLA-DMAP28067 ABCC1-202ENST00000399410 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
HLA-DMAP28067 SEMA4D-204ENST00000420101 1837 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
HLA-DMAP28067 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
HLA-DMAP28067 PLXNC1-202ENST00000545312 1813 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
HLA-DMAP28067 RALGDS-202ENST00000372050 3634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
HLA-DMAP28067 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
HLA-DMAP28067 NRG2-209ENST00000541337 3723 ntTSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
HLA-DMAP28067 NOS1AP-201ENST00000361897 4931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
HLA-DMAP28067 RTEL1-201ENST00000318100 4676 ntTSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
HLA-DMAP28067 PRDM6-201ENST00000407847 9267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
HLA-DMAP28067 PHF14-215ENST00000634607 3407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
HLA-DMAP28067 TTC28-AS1-219ENST00000454741 5064 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
HLA-DMAP28067 HOXA-AS2-202ENST00000517635 2455 ntTSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
HLA-DMAP28067 UNC13B-203ENST00000396787 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
HLA-DMAP28067 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
HLA-DMAP28067 TARSL2-201ENST00000335968 3610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
HLA-DMAP28067 SEC63-201ENST00000369002 6411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
HLA-DMAP28067 AC007326.2-201ENST00000624224 7579 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
HLA-DMAP28067 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
HLA-DMAP28067 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
HLA-DMAP28067 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
HLA-DMAP28067 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
HLA-DMAP28067 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
HLA-DMAP28067 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
HLA-DMAP28067 GRK6-203ENST00000393576 2792 ntTSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
HLA-DMAP28067 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
HLA-DMAP28067 ELMOD1-201ENST00000265840 2852 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
HLA-DMAP28067 MAGEA2B-202ENST00000370293 1714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
HLA-DMAP28067 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
HLA-DMAP28067 LINC00926-201ENST00000501726 2530 ntTSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.8 ms