Protein–RNA interactions for Protein: P26006

ITGA3, Integrin alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,051 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA3P26006 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ITGA3P26006 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ITGA3P26006 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ITGA3P26006 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ITGA3P26006 DENND4C-209ENST00000602925 6831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ITGA3P26006 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ITGA3P26006 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ITGA3P26006 GABARAPL1-202ENST00000421801 855 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ITGA3P26006 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ITGA3P26006 UBE2H-204ENST00000473814 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ITGA3P26006 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ITGA3P26006 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ITGA3P26006 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ITGA3P26006 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
ITGA3P26006 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ITGA3P26006 RBP1-207ENST00000619087 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ITGA3P26006 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ITGA3P26006 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ITGA3P26006 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ITGA3P26006 AC022144.1-201ENST00000602255 1580 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
ITGA3P26006 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ITGA3P26006 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ITGA3P26006 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ITGA3P26006 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ITGA3P26006 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ITGA3P26006 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ITGA3P26006 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ITGA3P26006 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ITGA3P26006 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ITGA3P26006 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ITGA3P26006 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ITGA3P26006 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ITGA3P26006 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ITGA3P26006 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ITGA3P26006 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ITGA3P26006 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ITGA3P26006 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ITGA3P26006 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ITGA3P26006 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ITGA3P26006 PCDHA10-201ENST00000307360 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ITGA3P26006 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
ITGA3P26006 IQCE-203ENST00000402050 6844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ITGA3P26006 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ITGA3P26006 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ITGA3P26006 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ITGA3P26006 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ITGA3P26006 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ITGA3P26006 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ITGA3P26006 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ITGA3P26006 LST1-202ENST00000303757 604 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ITGA3P26006 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ITGA3P26006 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ITGA3P26006 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ITGA3P26006 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ITGA3P26006 GAPDHP21-201ENST00000450301 1010 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
ITGA3P26006 AL359815.1-201ENST00000457706 821 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ITGA3P26006 RBAKDN-201ENST00000498308 514 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ITGA3P26006 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ITGA3P26006 SERBP1P5-201ENST00000510079 1181 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
ITGA3P26006 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ITGA3P26006 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ITGA3P26006 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ITGA3P26006 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ITGA3P26006 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ITGA3P26006 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ITGA3P26006 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
ITGA3P26006 XK-201ENST00000378616 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
ITGA3P26006 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.02
ITGA3P26006 TDG-209ENST00000544861 1387 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
ITGA3P26006 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
ITGA3P26006 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC15.21■□□□□ 0.02
ITGA3P26006 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC15.21■□□□□ 0.02
ITGA3P26006 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
ITGA3P26006 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ITGA3P26006 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ITGA3P26006 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ITGA3P26006 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ITGA3P26006 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ITGA3P26006 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ITGA3P26006 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ITGA3P26006 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ITGA3P26006 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ITGA3P26006 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ITGA3P26006 BMP7-201ENST00000395863 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ITGA3P26006 MBNL1-202ENST00000282488 6458 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ITGA3P26006 PHLDA1-203ENST00000619060 5913 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ITGA3P26006 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ITGA3P26006 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ITGA3P26006 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ITGA3P26006 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ITGA3P26006 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
ITGA3P26006 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ITGA3P26006 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ITGA3P26006 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ITGA3P26006 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ITGA3P26006 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ITGA3P26006 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ITGA3P26006 WFDC3-204ENST00000372632 704 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ITGA3P26006 AC093702.1-201ENST00000423433 367 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ITGA3P26006 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.2 ms