Protein–RNA interactions for Protein: P20248

CCNA2, Cyclin-A2, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNA2P20248 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCNA2P20248 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCNA2P20248 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CCNA2P20248 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCNA2P20248 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCNA2P20248 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCNA2P20248 CBS-204ENST00000398165 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCNA2P20248 ZNF334-202ENST00000457685 3487 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCNA2P20248 UBE2J1-201ENST00000435041 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCNA2P20248 MFSD14B-201ENST00000375344 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCNA2P20248 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCNA2P20248 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCNA2P20248 FOXB1-201ENST00000396057 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCNA2P20248 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCNA2P20248 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCNA2P20248 KCTD7-206ENST00000639828 5951 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCNA2P20248 VLDLR-202ENST00000382099 3240 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCNA2P20248 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCNA2P20248 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCNA2P20248 SLC9A7-205ENST00000616978 10024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCNA2P20248 LAT2-202ENST00000344995 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCNA2P20248 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCNA2P20248 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCNA2P20248 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCNA2P20248 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCNA2P20248 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCNA2P20248 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCNA2P20248 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCNA2P20248 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CCNA2P20248 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCNA2P20248 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCNA2P20248 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CCNA2P20248 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCNA2P20248 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCNA2P20248 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCNA2P20248 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CCNA2P20248 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CCNA2P20248 MLKL-202ENST00000308807 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
CCNA2P20248 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
CCNA2P20248 TEN1-CDK3-202ENST00000569284 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
CCNA2P20248 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CCNA2P20248 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CCNA2P20248 PLAGL1-208ENST00000437412 2640 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CCNA2P20248 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CCNA2P20248 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCNA2P20248 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCNA2P20248 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCNA2P20248 ALG12-201ENST00000330817 5350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCNA2P20248 AC138035.3-201ENST00000622706 2791 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CCNA2P20248 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCNA2P20248 HMOX2-204ENST00000414777 1752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCNA2P20248 LZTR1-201ENST00000215739 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCNA2P20248 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCNA2P20248 DMPK-202ENST00000343373 3227 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCNA2P20248 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCNA2P20248 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCNA2P20248 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCNA2P20248 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCNA2P20248 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCNA2P20248 SFRP4-201ENST00000436072 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCNA2P20248 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCNA2P20248 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCNA2P20248 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCNA2P20248 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCNA2P20248 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCNA2P20248 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCNA2P20248 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCNA2P20248 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCNA2P20248 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCNA2P20248 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCNA2P20248 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCNA2P20248 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCNA2P20248 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCNA2P20248 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCNA2P20248 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCNA2P20248 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCNA2P20248 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCNA2P20248 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCNA2P20248 REEP3-201ENST00000373758 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCNA2P20248 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCNA2P20248 PDP1-201ENST00000297598 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCNA2P20248 CEP170B-202ENST00000414716 6705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCNA2P20248 SHROOM2-201ENST00000380913 7447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCNA2P20248 CAMKK2-211ENST00000538733 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCNA2P20248 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCNA2P20248 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCNA2P20248 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCNA2P20248 CACNA1I-203ENST00000404898 9892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCNA2P20248 TMEM127-201ENST00000258439 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCNA2P20248 PPM1F-203ENST00000407142 5587 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCNA2P20248 FNDC1-201ENST00000297267 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCNA2P20248 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCNA2P20248 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCNA2P20248 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCNA2P20248 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCNA2P20248 SPHK2-210ENST00000599748 2683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCNA2P20248 SH2D3C-206ENST00000429553 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCNA2P20248 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CCNA2P20248 CASC3-201ENST00000264645 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCNA2P20248 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.1 ms