Protein–RNA interactions for Protein: P19429

TNNI3, Troponin I, cardiac muscle, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNI3P19429 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TNNI3P19429 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TNNI3P19429 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TNNI3P19429 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TNNI3P19429 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TNNI3P19429 LATS2-201ENST00000382592 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TNNI3P19429 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TNNI3P19429 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TNNI3P19429 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TNNI3P19429 EIF4G1-203ENST00000350481 4990 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TNNI3P19429 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TNNI3P19429 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TNNI3P19429 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TNNI3P19429 RTN3-205ENST00000356000 2645 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TNNI3P19429 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TNNI3P19429 TGOLN2-203ENST00000398263 6138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TNNI3P19429 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TNNI3P19429 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
TNNI3P19429 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TNNI3P19429 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TNNI3P19429 PER2-201ENST00000254657 6385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TNNI3P19429 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
TNNI3P19429 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
TNNI3P19429 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TNNI3P19429 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TNNI3P19429 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TNNI3P19429 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TNNI3P19429 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TNNI3P19429 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
TNNI3P19429 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TNNI3P19429 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TNNI3P19429 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TNNI3P19429 PAFAH1B1-202ENST00000397195 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TNNI3P19429 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TNNI3P19429 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TNNI3P19429 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TNNI3P19429 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TNNI3P19429 SDK1-210ENST00000615806 10258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TNNI3P19429 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TNNI3P19429 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TNNI3P19429 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TNNI3P19429 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TNNI3P19429 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TNNI3P19429 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TNNI3P19429 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TNNI3P19429 C18orf25-203ENST00000615052 5462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TNNI3P19429 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TNNI3P19429 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TNNI3P19429 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TNNI3P19429 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TNNI3P19429 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TNNI3P19429 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
TNNI3P19429 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
TNNI3P19429 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
TNNI3P19429 STAT5B-201ENST00000293328 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
TNNI3P19429 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
TNNI3P19429 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
TNNI3P19429 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
TNNI3P19429 PAK4-208ENST00000599386 5735 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
TNNI3P19429 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
TNNI3P19429 CLASP2-203ENST00000359576 7141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
TNNI3P19429 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
TNNI3P19429 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
TNNI3P19429 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TNNI3P19429 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TNNI3P19429 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TNNI3P19429 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TNNI3P19429 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TNNI3P19429 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TNNI3P19429 KANK2-201ENST00000586659 5162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TNNI3P19429 KMT2E-201ENST00000257745 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TNNI3P19429 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TNNI3P19429 RNASEH2B-202ENST00000422660 4830 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TNNI3P19429 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TNNI3P19429 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TNNI3P19429 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TNNI3P19429 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TNNI3P19429 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TNNI3P19429 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TNNI3P19429 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
TNNI3P19429 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TNNI3P19429 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TNNI3P19429 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TNNI3P19429 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TNNI3P19429 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TNNI3P19429 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TNNI3P19429 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TNNI3P19429 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TNNI3P19429 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TNNI3P19429 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TNNI3P19429 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TNNI3P19429 ITPRIPL2-201ENST00000381440 7247 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TNNI3P19429 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TNNI3P19429 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TNNI3P19429 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TNNI3P19429 TAP2-201ENST00000374897 5684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TNNI3P19429 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TNNI3P19429 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TNNI3P19429 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TNNI3P19429 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.6 ms