Protein–RNA interactions for Protein: P13569

CFTR, Cystic fibrosis transmembrane conductance regulator, humanhuman

Predictions only

Length 1,480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFTRP13569 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CFTRP13569 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
CFTRP13569 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CFTRP13569 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
CFTRP13569 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CFTRP13569 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CFTRP13569 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CFTRP13569 RGS10-202ENST00000369103 804 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CFTRP13569 CPLX2-202ENST00000393745 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CFTRP13569 AL445430.1-201ENST00000419796 699 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CFTRP13569 AC012640.1-201ENST00000509915 688 ntTSL 3 BASIC27.28■■□□□ 1.96
CFTRP13569 LCN10-206ENST00000527229 615 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CFTRP13569 RERG-205ENST00000537647 935 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
CFTRP13569 AC145423.3-201ENST00000615987 467 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
CFTRP13569 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
CFTRP13569 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CFTRP13569 RNASEH1-201ENST00000315212 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CFTRP13569 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
CFTRP13569 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
CFTRP13569 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
CFTRP13569 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CFTRP13569 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
CFTRP13569 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CFTRP13569 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CFTRP13569 RPL39L-201ENST00000296277 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CFTRP13569 GABARAPL2-201ENST00000037243 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CFTRP13569 PDGFB-202ENST00000381551 1125 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
CFTRP13569 CAMKMT-203ENST00000403853 1114 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CFTRP13569 CNN2P10-201ENST00000443067 918 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
CFTRP13569 NME2-207ENST00000514264 850 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
CFTRP13569 TMBIM4-205ENST00000535812 766 ntTSL 4 BASIC27.27■■□□□ 1.96
CFTRP13569 ANAPC15-214ENST00000543587 883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CFTRP13569 TMBIM4-212ENST00000556010 610 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
CFTRP13569 AC021594.1-201ENST00000587174 636 ntTSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
CFTRP13569 AC092634.5-202ENST00000587736 928 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
CFTRP13569 MFSD11-218ENST00000591864 446 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CFTRP13569 AP005019.2-201ENST00000615104 511 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
CFTRP13569 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CFTRP13569 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CFTRP13569 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
CFTRP13569 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CFTRP13569 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
CFTRP13569 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
CFTRP13569 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
CFTRP13569 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CFTRP13569 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CFTRP13569 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.27■■□□□ 1.96
CFTRP13569 PSME1-201ENST00000206451 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CFTRP13569 CD8B2-202ENST00000417670 633 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
CFTRP13569 PRKG1-AS1-201ENST00000420193 971 ntTSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.95
CFTRP13569 AC083949.1-202ENST00000458490 552 ntTSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.95
CFTRP13569 PCOLCE2-208ENST00000485766 1088 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
CFTRP13569 IGHV3OR16-9-202ENST00000558425 288 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
CFTRP13569 RPL28-208ENST00000559463 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CFTRP13569 AC104982.3-201ENST00000581995 514 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
CFTRP13569 ANGPTL8-203ENST00000591200 504 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CFTRP13569 AC091812.3-201ENST00000621362 345 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
CFTRP13569 LINC01002-220ENST00000632790 449 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
CFTRP13569 VGLL2-202ENST00000352536 1709 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CFTRP13569 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CFTRP13569 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CFTRP13569 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CFTRP13569 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
CFTRP13569 KRT9-202ENST00000588431 1493 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CFTRP13569 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CFTRP13569 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CFTRP13569 CBY1-201ENST00000216029 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CFTRP13569 YIPF7-201ENST00000332990 937 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
CFTRP13569 TNFAIP8L2-201ENST00000368910 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CFTRP13569 VCPKMT-201ENST00000395859 795 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CFTRP13569 FNTAP2-201ENST00000430308 634 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
CFTRP13569 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CFTRP13569 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
CFTRP13569 ANXA8L1-208ENST00000622769 1861 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CFTRP13569 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC27.25■■□□□ 1.95
CFTRP13569 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CFTRP13569 MFSD4A-207ENST00000536357 1841 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
CFTRP13569 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
CFTRP13569 DBNDD2-201ENST00000357275 1036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
CFTRP13569 CSNK2B-201ENST00000375865 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
CFTRP13569 MIR1202-201ENST00000408529 83 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
CFTRP13569 HBS1L-208ENST00000525067 582 ntTSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
CFTRP13569 AP001582.1-201ENST00000525856 295 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
CFTRP13569 NIP7-208ENST00000569637 1099 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
CFTRP13569 PRCD-204ENST00000586148 630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
CFTRP13569 PRCD-210ENST00000592014 462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CFTRP13569 AL450472.2-201ENST00000603663 1156 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
CFTRP13569 ARID1B-222ENST00000637003 1290 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
CFTRP13569 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CFTRP13569 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
CFTRP13569 HSFX2-201ENST00000598963 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CFTRP13569 PKIG-204ENST00000372889 1489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
CFTRP13569 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
CFTRP13569 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
CFTRP13569 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
CFTRP13569 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CFTRP13569 AC091046.1-201ENST00000331871 207 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
CFTRP13569 BEX5-201ENST00000333643 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CFTRP13569 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CFTRP13569 IGHV3-21-201ENST00000390607 430 ntAPPRIS P1 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms