Protein–RNA interactions for Protein: P13073

COX4I1, Cytochrome c oxidase subunit 4 isoform 1, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 169 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COX4I1P13073 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
COX4I1P13073 AL669918.1-201ENST00000452392 2705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
COX4I1P13073 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
COX4I1P13073 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
COX4I1P13073 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
COX4I1P13073 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
COX4I1P13073 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
COX4I1P13073 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
COX4I1P13073 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
COX4I1P13073 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
COX4I1P13073 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
COX4I1P13073 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
COX4I1P13073 SLC47A1-203ENST00000436810 1719 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
COX4I1P13073 GRID2IP-202ENST00000452113 3428 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
COX4I1P13073 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
COX4I1P13073 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
COX4I1P13073 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
COX4I1P13073 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
COX4I1P13073 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
COX4I1P13073 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
COX4I1P13073 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
COX4I1P13073 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
COX4I1P13073 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
COX4I1P13073 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
COX4I1P13073 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
COX4I1P13073 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
COX4I1P13073 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
COX4I1P13073 ZBTB37-203ENST00000367704 2323 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
COX4I1P13073 PCDHB8-201ENST00000239444 2740 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
COX4I1P13073 KREMEN1-201ENST00000327813 2719 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
COX4I1P13073 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
COX4I1P13073 USP25-201ENST00000285679 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
COX4I1P13073 AC106881.1-201ENST00000605849 3329 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
COX4I1P13073 SIGLEC11-202ENST00000426971 2479 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
COX4I1P13073 ELMOD1-201ENST00000265840 2852 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
COX4I1P13073 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
COX4I1P13073 ZNF324B-201ENST00000336614 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
COX4I1P13073 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
COX4I1P13073 NCK2-203ENST00000393349 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
COX4I1P13073 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
COX4I1P13073 PHKG2-204ENST00000563588 5539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
COX4I1P13073 FMR1-203ENST00000370470 1774 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
COX4I1P13073 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
COX4I1P13073 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
COX4I1P13073 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
COX4I1P13073 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
COX4I1P13073 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
COX4I1P13073 PPIL2-212ENST00000626352 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
COX4I1P13073 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
COX4I1P13073 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
COX4I1P13073 ARHGEF16-201ENST00000378371 2219 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
COX4I1P13073 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
COX4I1P13073 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
COX4I1P13073 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
COX4I1P13073 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
COX4I1P13073 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
COX4I1P13073 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
COX4I1P13073 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
COX4I1P13073 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
COX4I1P13073 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
COX4I1P13073 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
COX4I1P13073 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
COX4I1P13073 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
COX4I1P13073 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
COX4I1P13073 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
COX4I1P13073 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
COX4I1P13073 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
COX4I1P13073 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
COX4I1P13073 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
COX4I1P13073 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
COX4I1P13073 NBPF9-207ENST00000615421 5835 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
COX4I1P13073 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
COX4I1P13073 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
COX4I1P13073 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
COX4I1P13073 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
COX4I1P13073 RRM1-214ENST00000534285 2075 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
COX4I1P13073 PWP2-201ENST00000291576 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
COX4I1P13073 TTC13-201ENST00000366661 3253 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
COX4I1P13073 ZFP41-203ENST00000520584 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
COX4I1P13073 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
COX4I1P13073 LZTR1-201ENST00000215739 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
COX4I1P13073 EPHX2-209ENST00000521780 2038 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
COX4I1P13073 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
COX4I1P13073 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
COX4I1P13073 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
COX4I1P13073 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
COX4I1P13073 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
COX4I1P13073 SNX18-202ENST00000343017 3140 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
COX4I1P13073 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
COX4I1P13073 WASHC2C-208ENST00000537517 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
COX4I1P13073 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
COX4I1P13073 ALDH3A2-221ENST00000581518 2785 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
COX4I1P13073 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
COX4I1P13073 HNRNPK-204ENST00000376263 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
COX4I1P13073 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
COX4I1P13073 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
COX4I1P13073 MAP7D1-203ENST00000373150 3238 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
COX4I1P13073 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
COX4I1P13073 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
COX4I1P13073 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.9 ms