Protein–RNA interactions for Protein: P11926

ODC1, Ornithine decarboxylase, humanhuman

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODC1P11926 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ODC1P11926 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
ODC1P11926 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ODC1P11926 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ODC1P11926 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ODC1P11926 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ODC1P11926 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ODC1P11926 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ODC1P11926 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
ODC1P11926 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ODC1P11926 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ODC1P11926 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ODC1P11926 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ODC1P11926 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ODC1P11926 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ODC1P11926 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ODC1P11926 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ODC1P11926 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ODC1P11926 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ODC1P11926 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ODC1P11926 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ODC1P11926 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ODC1P11926 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ODC1P11926 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ODC1P11926 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ODC1P11926 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ODC1P11926 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ODC1P11926 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ODC1P11926 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ODC1P11926 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ODC1P11926 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ODC1P11926 GABARAPL1-202ENST00000421801 855 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ODC1P11926 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ODC1P11926 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ODC1P11926 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ODC1P11926 RBAKDN-201ENST00000498308 514 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ODC1P11926 SERBP1P5-201ENST00000510079 1181 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
ODC1P11926 AC106795.3-201ENST00000511650 547 ntTSL 4 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ODC1P11926 CPLX2-206ENST00000512824 518 ntTSL 4 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ODC1P11926 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ODC1P11926 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
ODC1P11926 LINC02387-201ENST00000541749 868 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ODC1P11926 AL512361.1-201ENST00000554200 418 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
ODC1P11926 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
ODC1P11926 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
ODC1P11926 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ODC1P11926 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ODC1P11926 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ODC1P11926 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ODC1P11926 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ODC1P11926 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
ODC1P11926 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ODC1P11926 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ODC1P11926 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ODC1P11926 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ODC1P11926 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ODC1P11926 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ODC1P11926 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ODC1P11926 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ODC1P11926 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ODC1P11926 AC006974.1-201ENST00000637928 1501 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ODC1P11926 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ODC1P11926 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ODC1P11926 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ODC1P11926 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ODC1P11926 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ODC1P11926 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ODC1P11926 AC009407.1-201ENST00000568958 598 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
ODC1P11926 PRR29-204ENST00000577953 565 ntTSL 4 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ODC1P11926 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ODC1P11926 MIR6069-201ENST00000620069 79 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
ODC1P11926 AL033527.5-202ENST00000641632 1098 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
ODC1P11926 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ODC1P11926 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ODC1P11926 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ODC1P11926 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ODC1P11926 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ODC1P11926 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ODC1P11926 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ODC1P11926 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ODC1P11926 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ODC1P11926 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ODC1P11926 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ODC1P11926 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ODC1P11926 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ODC1P11926 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ODC1P11926 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ODC1P11926 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ODC1P11926 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ODC1P11926 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ODC1P11926 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ODC1P11926 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ODC1P11926 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ODC1P11926 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ODC1P11926 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ODC1P11926 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ODC1P11926 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ODC1P11926 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ODC1P11926 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ODC1P11926 BTBD7P1-201ENST00000447253 1453 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40 ms