Protein–RNA interactions for Protein: P11686

SFTPC, Pulmonary surfactant-associated protein C, humanhuman

Predictions only

Length 197 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFTPCP11686 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
SFTPCP11686 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC14.77□□□□□ -0.04
SFTPCP11686 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
SFTPCP11686 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
SFTPCP11686 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
SFTPCP11686 UPK3A-201ENST00000216211 1051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
SFTPCP11686 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
SFTPCP11686 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
SFTPCP11686 AL592464.1-201ENST00000429389 429 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
SFTPCP11686 AC139149.1-202ENST00000442532 783 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
SFTPCP11686 AC093904.2-201ENST00000495580 418 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
SFTPCP11686 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
SFTPCP11686 LYRM9-204ENST00000503642 432 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
SFTPCP11686 CEP57L1-208ENST00000519095 908 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
SFTPCP11686 PLEKHA7-214ENST00000532079 565 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
SFTPCP11686 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
SFTPCP11686 AC011489.1-202ENST00000586556 618 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
SFTPCP11686 AC025048.3-201ENST00000590609 569 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
SFTPCP11686 KLK15-203ENST00000596931 692 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
SFTPCP11686 AC005702.4-201ENST00000618393 416 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
SFTPCP11686 PPA1-206ENST00000625364 644 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
SFTPCP11686 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
SFTPCP11686 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
SFTPCP11686 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
SFTPCP11686 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
SFTPCP11686 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
SFTPCP11686 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
SFTPCP11686 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.05
SFTPCP11686 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
SFTPCP11686 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
SFTPCP11686 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
SFTPCP11686 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
SFTPCP11686 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
SFTPCP11686 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
SFTPCP11686 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
SFTPCP11686 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SFTPCP11686 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SFTPCP11686 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SFTPCP11686 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SFTPCP11686 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SFTPCP11686 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SFTPCP11686 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SFTPCP11686 RHD-204ENST00000417538 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SFTPCP11686 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SFTPCP11686 C1orf123-201ENST00000294360 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SFTPCP11686 NPPC-201ENST00000295440 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SFTPCP11686 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SFTPCP11686 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SFTPCP11686 RUFY2-202ENST00000342616 983 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SFTPCP11686 RHCE-205ENST00000349438 1235 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SFTPCP11686 AC104596.1-201ENST00000507826 579 ntTSL 4 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SFTPCP11686 AL161781.2-201ENST00000509911 739 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SFTPCP11686 IFITM3-202ENST00000526811 543 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SFTPCP11686 AL021546.1-201ENST00000551806 552 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SFTPCP11686 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SFTPCP11686 LINC02205-201ENST00000559752 239 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SFTPCP11686 ZFR2-208ENST00000592398 532 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SFTPCP11686 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SFTPCP11686 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SFTPCP11686 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SFTPCP11686 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SFTPCP11686 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SFTPCP11686 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SFTPCP11686 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SFTPCP11686 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SFTPCP11686 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SFTPCP11686 AL662899.1-201ENST00000461287 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SFTPCP11686 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SFTPCP11686 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SFTPCP11686 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SFTPCP11686 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SFTPCP11686 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SFTPCP11686 ACP2-205ENST00000527256 1499 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SFTPCP11686 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SFTPCP11686 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SFTPCP11686 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SFTPCP11686 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SFTPCP11686 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SFTPCP11686 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SFTPCP11686 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SFTPCP11686 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SFTPCP11686 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SFTPCP11686 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SFTPCP11686 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SFTPCP11686 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SFTPCP11686 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SFTPCP11686 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SFTPCP11686 ING4-202ENST00000396807 1393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SFTPCP11686 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SFTPCP11686 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SFTPCP11686 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SFTPCP11686 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SFTPCP11686 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SFTPCP11686 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SFTPCP11686 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SFTPCP11686 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SFTPCP11686 CFLAR-203ENST00000341222 1283 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SFTPCP11686 MGST3-203ENST00000367885 680 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SFTPCP11686 RABL2A-203ENST00000393166 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SFTPCP11686 USB1-202ENST00000423271 1217 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
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