Protein–RNA interactions for Protein: P0C875

FAM228B, Protein FAM228B, humanhuman

Predictions only

Length 321 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM228BP0C875 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
FAM228BP0C875 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
FAM228BP0C875 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
FAM228BP0C875 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
FAM228BP0C875 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
FAM228BP0C875 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
FAM228BP0C875 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
FAM228BP0C875 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
FAM228BP0C875 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
FAM228BP0C875 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
FAM228BP0C875 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
FAM228BP0C875 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
FAM228BP0C875 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
FAM228BP0C875 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
FAM228BP0C875 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
FAM228BP0C875 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
FAM228BP0C875 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
FAM228BP0C875 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
FAM228BP0C875 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
FAM228BP0C875 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
FAM228BP0C875 TLE4-204ENST00000376537 2793 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
FAM228BP0C875 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
FAM228BP0C875 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
FAM228BP0C875 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
FAM228BP0C875 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
FAM228BP0C875 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
FAM228BP0C875 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
FAM228BP0C875 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
FAM228BP0C875 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
FAM228BP0C875 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
FAM228BP0C875 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
FAM228BP0C875 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
FAM228BP0C875 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
FAM228BP0C875 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
FAM228BP0C875 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
FAM228BP0C875 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
FAM228BP0C875 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
FAM228BP0C875 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
FAM228BP0C875 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
FAM228BP0C875 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
FAM228BP0C875 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
FAM228BP0C875 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
FAM228BP0C875 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
FAM228BP0C875 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.37■□□□□ 0.37
FAM228BP0C875 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
FAM228BP0C875 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
FAM228BP0C875 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
FAM228BP0C875 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
FAM228BP0C875 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
FAM228BP0C875 TNFRSF14-AS1-202ENST00000432521 3608 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
FAM228BP0C875 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
FAM228BP0C875 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
FAM228BP0C875 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
FAM228BP0C875 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
FAM228BP0C875 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
FAM228BP0C875 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
FAM228BP0C875 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
FAM228BP0C875 NRBP1-201ENST00000233557 2887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
FAM228BP0C875 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
FAM228BP0C875 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
FAM228BP0C875 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
FAM228BP0C875 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
FAM228BP0C875 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
FAM228BP0C875 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
FAM228BP0C875 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
FAM228BP0C875 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
FAM228BP0C875 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
FAM228BP0C875 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
FAM228BP0C875 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
FAM228BP0C875 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
FAM228BP0C875 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
FAM228BP0C875 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
FAM228BP0C875 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
FAM228BP0C875 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
FAM228BP0C875 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
FAM228BP0C875 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
FAM228BP0C875 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
FAM228BP0C875 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
FAM228BP0C875 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
FAM228BP0C875 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
FAM228BP0C875 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
FAM228BP0C875 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
FAM228BP0C875 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
FAM228BP0C875 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
FAM228BP0C875 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
FAM228BP0C875 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
FAM228BP0C875 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
FAM228BP0C875 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
FAM228BP0C875 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC17.36■□□□□ 0.37
FAM228BP0C875 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
FAM228BP0C875 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
FAM228BP0C875 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
FAM228BP0C875 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
FAM228BP0C875 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
FAM228BP0C875 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
FAM228BP0C875 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
FAM228BP0C875 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
FAM228BP0C875 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
FAM228BP0C875 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
FAM228BP0C875 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.2 ms