Protein–RNA interactions for Protein: O43772

SLC25A20, Mitochondrial carnitine/acylcarnitine carrier protein, humanhuman

Predictions only

Length 301 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC25A20O43772 GALNT4-201ENST00000529983 5399 ntAPPRIS P1 BASIC11.04□□□□□ -0.64
SLC25A20O43772 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
SLC25A20O43772 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
SLC25A20O43772 SNX33-201ENST00000308527 8008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
SLC25A20O43772 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
SLC25A20O43772 RSPH9-202ENST00000372165 2586 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
SLC25A20O43772 MIER1-208ENST00000401041 2552 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
SLC25A20O43772 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
SLC25A20O43772 GRIK5-201ENST00000262895 3493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
SLC25A20O43772 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
SLC25A20O43772 OR52A1-202ENST00000380367 9783 ntAPPRIS P1 BASIC11.04□□□□□ -0.64
SLC25A20O43772 RABIF-201ENST00000367262 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
SLC25A20O43772 MECR-202ENST00000373791 2416 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
SLC25A20O43772 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
SLC25A20O43772 SERINC2-206ENST00000536859 2072 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
SLC25A20O43772 ZC3HAV1-204ENST00000471652 3182 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
SLC25A20O43772 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
SLC25A20O43772 UBA5-202ENST00000356232 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
SLC25A20O43772 CR383656.2-201ENST00000548656 2254 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
SLC25A20O43772 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
SLC25A20O43772 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
SLC25A20O43772 WDR27-201ENST00000423258 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
SLC25A20O43772 USP6NL-205ENST00000609104 11377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
SLC25A20O43772 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
SLC25A20O43772 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
SLC25A20O43772 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
SLC25A20O43772 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
SLC25A20O43772 MTMR3-204ENST00000401950 6018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
SLC25A20O43772 POR-201ENST00000394893 2532 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
SLC25A20O43772 DDX50-206ENST00000610822 2510 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
SLC25A20O43772 GLIS3-201ENST00000324333 6667 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
SLC25A20O43772 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
SLC25A20O43772 ZNF256-201ENST00000282308 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
SLC25A20O43772 DUOX2-201ENST00000389039 6533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
SLC25A20O43772 ZNF586-203ENST00000396154 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
SLC25A20O43772 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
SLC25A20O43772 SAMD4A-201ENST00000251091 6565 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
SLC25A20O43772 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
SLC25A20O43772 FER1L4-213ENST00000621044 2778 ntTSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
SLC25A20O43772 GOLGA5-201ENST00000163416 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
SLC25A20O43772 TRIM29-210ENST00000528870 2217 ntTSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
SLC25A20O43772 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
SLC25A20O43772 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
SLC25A20O43772 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
SLC25A20O43772 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
SLC25A20O43772 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
SLC25A20O43772 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC11.03□□□□□ -0.64
SLC25A20O43772 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
SLC25A20O43772 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
SLC25A20O43772 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
SLC25A20O43772 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC11.03□□□□□ -0.64
SLC25A20O43772 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
SLC25A20O43772 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC11.03□□□□□ -0.64
SLC25A20O43772 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
SLC25A20O43772 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
SLC25A20O43772 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
SLC25A20O43772 TPD52-201ENST00000379096 4041 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
SLC25A20O43772 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
SLC25A20O43772 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
SLC25A20O43772 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
SLC25A20O43772 SFXN3-202ENST00000393459 3098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
SLC25A20O43772 CDH11-201ENST00000268603 6857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
SLC25A20O43772 ZNF536-201ENST00000355537 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
SLC25A20O43772 RAB18-208ENST00000611151 4931 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
SLC25A20O43772 ROBO4-201ENST00000306534 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
SLC25A20O43772 GLUL-203ENST00000339526 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
SLC25A20O43772 PLEKHO2-201ENST00000323544 3720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
SLC25A20O43772 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
SLC25A20O43772 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
SLC25A20O43772 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
SLC25A20O43772 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
SLC25A20O43772 KIAA0513-201ENST00000258180 7404 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
SLC25A20O43772 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
SLC25A20O43772 CACNA1G-226ENST00000513689 6879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
SLC25A20O43772 CACNA1G-231ENST00000515165 6870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
SLC25A20O43772 EPHB3-201ENST00000330394 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
SLC25A20O43772 SPRY4-202ENST00000434127 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
SLC25A20O43772 MORC4-202ENST00000355610 3834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
SLC25A20O43772 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
SLC25A20O43772 ABCG1-203ENST00000361802 3034 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
SLC25A20O43772 NCOR2-201ENST00000356219 7226 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
SLC25A20O43772 ROBO1-213ENST00000618846 7483 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
SLC25A20O43772 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
SLC25A20O43772 ZNF664-204ENST00000538932 4321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.03□□□□□ -0.64
SLC25A20O43772 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.03□□□□□ -0.64
SLC25A20O43772 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
SLC25A20O43772 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
SLC25A20O43772 LINC00887-202ENST00000414120 2880 ntTSL 3 BASIC11.02□□□□□ -0.64
SLC25A20O43772 AL390755.1-201ENST00000623716 2027 ntBASIC11.02□□□□□ -0.64
SLC25A20O43772 SLC52A3-201ENST00000217254 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.64
SLC25A20O43772 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
SLC25A20O43772 PMPCB-201ENST00000249269 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
SLC25A20O43772 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
SLC25A20O43772 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
SLC25A20O43772 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
SLC25A20O43772 AMPD2-218ENST00000528454 2728 ntTSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.64
SLC25A20O43772 CLPTM1-202ENST00000541297 2732 ntTSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.64
SLC25A20O43772 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
SLC25A20O43772 CXorf36-201ENST00000377934 2513 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
SLC25A20O43772 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.1 ms