Protein–RNA interactions for Protein: O43157

PLXNB1, Plexin-B1, humanhuman

Predictions only

Length 2,135 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLXNB1O43157 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
PLXNB1O43157 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
PLXNB1O43157 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
PLXNB1O43157 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
PLXNB1O43157 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
PLXNB1O43157 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PLXNB1O43157 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PLXNB1O43157 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
PLXNB1O43157 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
PLXNB1O43157 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
PLXNB1O43157 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
PLXNB1O43157 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
PLXNB1O43157 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PLXNB1O43157 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PLXNB1O43157 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
PLXNB1O43157 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
PLXNB1O43157 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
PLXNB1O43157 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
PLXNB1O43157 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
PLXNB1O43157 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PLXNB1O43157 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
PLXNB1O43157 WBP2-203ENST00000433525 928 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
PLXNB1O43157 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PLXNB1O43157 PTGES3-205ENST00000456859 957 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
PLXNB1O43157 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PLXNB1O43157 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
PLXNB1O43157 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC13.15□□□□□ -0.3
PLXNB1O43157 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PLXNB1O43157 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PLXNB1O43157 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
PLXNB1O43157 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PLXNB1O43157 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
PLXNB1O43157 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PLXNB1O43157 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
PLXNB1O43157 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PLXNB1O43157 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
PLXNB1O43157 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PLXNB1O43157 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PLXNB1O43157 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
PLXNB1O43157 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
PLXNB1O43157 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
PLXNB1O43157 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
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PLXNB1O43157 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PLXNB1O43157 AC139713.2-206ENST00000499587 566 ntTSL 4 BASIC13.15□□□□□ -0.3
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PLXNB1O43157 INO80C-206ENST00000586489 594 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
PLXNB1O43157 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
PLXNB1O43157 AC010507.1-202ENST00000633286 381 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
PLXNB1O43157 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
PLXNB1O43157 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
PLXNB1O43157 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
PLXNB1O43157 CHN2-201ENST00000222792 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
PLXNB1O43157 ANKHD1-EIF4EBP3-203ENST00000532219 8246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.31
PLXNB1O43157 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PLXNB1O43157 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PLXNB1O43157 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PLXNB1O43157 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
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PLXNB1O43157 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PLXNB1O43157 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PLXNB1O43157 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
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PLXNB1O43157 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PLXNB1O43157 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
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PLXNB1O43157 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
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PLXNB1O43157 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PLXNB1O43157 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
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PLXNB1O43157 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PLXNB1O43157 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PLXNB1O43157 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PLXNB1O43157 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PLXNB1O43157 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PLXNB1O43157 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PLXNB1O43157 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PLXNB1O43157 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PLXNB1O43157 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PLXNB1O43157 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PLXNB1O43157 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PLXNB1O43157 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PLXNB1O43157 AL035252.4-201ENST00000624174 288 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
PLXNB1O43157 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
PLXNB1O43157 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PLXNB1O43157 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PLXNB1O43157 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PLXNB1O43157 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PLXNB1O43157 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PLXNB1O43157 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PLXNB1O43157 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PLXNB1O43157 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
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