Protein–RNA interactions for Protein: O00559

EBAG9, Receptor-binding cancer antigen expressed on SiSo cells, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EBAG9O00559 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
EBAG9O00559 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
EBAG9O00559 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
EBAG9O00559 ELP1-201ENST00000374647 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
EBAG9O00559 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
EBAG9O00559 AL354714.1-201ENST00000356006 2136 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
EBAG9O00559 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
EBAG9O00559 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
EBAG9O00559 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
EBAG9O00559 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
EBAG9O00559 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
EBAG9O00559 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
EBAG9O00559 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
EBAG9O00559 DUSP27-201ENST00000271385 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
EBAG9O00559 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
EBAG9O00559 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
EBAG9O00559 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
EBAG9O00559 CELP-203ENST00000624767 2414 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
EBAG9O00559 PIK3CG-201ENST00000359195 5377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
EBAG9O00559 EIF5-202ENST00000392715 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
EBAG9O00559 SIGLEC9-202ENST00000440804 1960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
EBAG9O00559 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
EBAG9O00559 TMBIM4-202ENST00000358230 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
EBAG9O00559 SEMA4F-210ENST00000611975 6007 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
EBAG9O00559 TBPL2-201ENST00000247219 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
EBAG9O00559 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
EBAG9O00559 UCP2-201ENST00000310473 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
EBAG9O00559 UBE2D1-201ENST00000373910 2659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
EBAG9O00559 TMEM181-201ENST00000367090 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
EBAG9O00559 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
EBAG9O00559 PRMT7-202ENST00000441236 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
EBAG9O00559 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
EBAG9O00559 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
EBAG9O00559 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
EBAG9O00559 ECE1-201ENST00000264205 2381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
EBAG9O00559 RAB43-202ENST00000393304 4230 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.34■□□□□ 0.21
EBAG9O00559 WDR27-201ENST00000423258 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
EBAG9O00559 RNF122-201ENST00000256257 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
EBAG9O00559 LPAR5-201ENST00000329858 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
EBAG9O00559 PVR-202ENST00000344956 3166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
EBAG9O00559 AGAP1-201ENST00000304032 10832 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
EBAG9O00559 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
EBAG9O00559 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
EBAG9O00559 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
EBAG9O00559 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
EBAG9O00559 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
EBAG9O00559 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
EBAG9O00559 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
EBAG9O00559 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
EBAG9O00559 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
EBAG9O00559 AC079447.1-201ENST00000424491 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
EBAG9O00559 AC090616.6-203ENST00000579186 1945 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
EBAG9O00559 ATRN-202ENST00000446916 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
EBAG9O00559 AC112693.3-201ENST00000624819 1983 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
EBAG9O00559 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
EBAG9O00559 NEDD4L-202ENST00000356462 3335 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
EBAG9O00559 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
EBAG9O00559 CPEB2-209ENST00000538197 6878 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
EBAG9O00559 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
EBAG9O00559 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
EBAG9O00559 HOXA3-201ENST00000317201 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
EBAG9O00559 GJD2-201ENST00000290374 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
EBAG9O00559 VWCE-202ENST00000335613 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
EBAG9O00559 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
EBAG9O00559 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
EBAG9O00559 LIMS1-215ENST00000544547 4461 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
EBAG9O00559 HTR7-203ENST00000371719 3033 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
EBAG9O00559 FAM47E-STBD1-204ENST00000515604 3029 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
EBAG9O00559 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
EBAG9O00559 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
EBAG9O00559 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
EBAG9O00559 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
EBAG9O00559 MAD1L1-203ENST00000402746 2355 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
EBAG9O00559 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
EBAG9O00559 GAP43-201ENST00000305124 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
EBAG9O00559 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
EBAG9O00559 CRYBG2-210ENST00000527815 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
EBAG9O00559 DIP2A-201ENST00000400274 7023 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
EBAG9O00559 KIAA0895L-202ENST00000561621 3500 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
EBAG9O00559 CHRNA7-201ENST00000306901 6181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
EBAG9O00559 ACTL6A-203ENST00000450518 1750 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
EBAG9O00559 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
EBAG9O00559 UNC5B-202ENST00000373192 6451 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
EBAG9O00559 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
EBAG9O00559 PTPRN-201ENST00000295718 3784 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
EBAG9O00559 ZBTB7B-207ENST00000535420 3777 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
EBAG9O00559 EXOC6B-202ENST00000410104 5795 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
EBAG9O00559 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
EBAG9O00559 SPAG9-201ENST00000262013 8273 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
EBAG9O00559 DNMT3B-204ENST00000353855 4237 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
EBAG9O00559 DDX20-201ENST00000369702 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
EBAG9O00559 GORAB-202ENST00000367763 2189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
EBAG9O00559 NADSYN1-216ENST00000530055 2416 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
EBAG9O00559 UNC13A-202ENST00000519716 9838 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
EBAG9O00559 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
EBAG9O00559 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
EBAG9O00559 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
EBAG9O00559 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
EBAG9O00559 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
EBAG9O00559 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.6 ms