Protein–RNA interactions for Protein: H3BUS1

SYS1-DBNDD2, SYS1-DBNDD2 readthrough (NMD candidate), humanhuman

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Length 97 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYS1-DBNDD2H3BUS1 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZSCAN32-215ENST00000618425 2788 ntTSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ELF4-201ENST00000308167 4165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
SYS1-DBNDD2H3BUS1 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
SYS1-DBNDD2H3BUS1 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.74□□□□□ -0.53
SYS1-DBNDD2H3BUS1 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LINC00174-204ENST00000421767 4702 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
SYS1-DBNDD2H3BUS1 INPP5B-204ENST00000373026 3230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
SYS1-DBNDD2H3BUS1 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC004223.3-201ENST00000593039 1638 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC11.74□□□□□ -0.53
SYS1-DBNDD2H3BUS1 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TMUB2-202ENST00000357984 1921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SLC4A7-213ENST00000454389 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
SYS1-DBNDD2H3BUS1 STEAP2-201ENST00000287908 6873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TUBGCP6-201ENST00000248846 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PCDHA9-202ENST00000532602 6293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NEDD4L-202ENST00000356462 3335 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SYNRG-231ENST00000622045 3859 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
SYS1-DBNDD2H3BUS1 KCNG4-201ENST00000308251 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SDC1-201ENST00000254351 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TFCP2-201ENST00000257915 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RBM6-201ENST00000266022 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CNOT10-201ENST00000328834 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
SYS1-DBNDD2H3BUS1 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DDX17-202ENST00000396821 4791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PROSER3-202ENST00000396908 2149 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DHCR7-202ENST00000407721 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PHF19-203ENST00000419155 3525 ntTSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MED12L-203ENST00000422248 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
SYS1-DBNDD2H3BUS1 C7orf57-203ENST00000430738 2056 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC11.73□□□□□ -0.53
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DMTN-214ENST00000519907 2658 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TNIP1-214ENST00000522226 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MON1B-203ENST00000545553 1814 ntTSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
SYS1-DBNDD2H3BUS1 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PLEKHO2-202ENST00000616065 3569 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZNF618-207ENST00000615615 9289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RUNX1T1-246ENST00000523629 7537 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AFDN-203ENST00000366806 5962 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SLC6A20-202ENST00000358525 5423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
SYS1-DBNDD2H3BUS1 UBE4B-201ENST00000253251 4772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CUEDC1-206ENST00000577830 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MBD1-201ENST00000269468 3259 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ING1-203ENST00000375774 2870 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
SYS1-DBNDD2H3BUS1 WDR77-201ENST00000235090 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
SYS1-DBNDD2H3BUS1 KIAA1257-204ENST00000511438 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PRKY-203ENST00000528056 7218 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SUGP2-214ENST00000600377 4752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PML-201ENST00000268058 4508 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GID4-201ENST00000268719 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC105250.1-201ENST00000509378 2057 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PPHLN1-201ENST00000256678 1820 ntTSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
SYS1-DBNDD2H3BUS1 VARS2-211ENST00000541562 3566 ntTSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC010424.3-201ENST00000635510 1745 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ARHGAP4-203ENST00000370028 3372 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
SYS1-DBNDD2H3BUS1 OFD1-204ENST00000398395 3307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
SYS1-DBNDD2H3BUS1 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
SYS1-DBNDD2H3BUS1 EBLN3P-202ENST00000625445 4520 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZMYM3-206ENST00000373988 6021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NFATC4-219ENST00000555167 4364 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZNF664-204ENST00000538932 4321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.72□□□□□ -0.53
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MAP3K11-208ENST00000530153 2830 ntTSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FGFR1-202ENST00000335922 4157 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
SYS1-DBNDD2H3BUS1 COL6A4P2-202ENST00000504443 2753 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SCYL1-205ENST00000524944 2715 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PDE8A-201ENST00000310298 3984 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CAVIN1-201ENST00000357037 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
SYS1-DBNDD2H3BUS1 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC11.72□□□□□ -0.53
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