Protein–RNA interactions for Protein: C9J069

C9orf172, Uncharacterized protein C9orf172, humanhuman

Predictions only

Length 976 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf172C9J069 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
C9orf172C9J069 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
C9orf172C9J069 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
C9orf172C9J069 PSORS1C3-201ENST00000412143 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
C9orf172C9J069 KRT43P-201ENST00000434019 910 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
C9orf172C9J069 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
C9orf172C9J069 FAM162A-202ENST00000469967 1015 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
C9orf172C9J069 HNRNPA1P13-201ENST00000510646 963 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
C9orf172C9J069 TROAP-207ENST00000548311 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
C9orf172C9J069 BX927359.1-201ENST00000556073 543 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
C9orf172C9J069 AC010491.1-203ENST00000564167 638 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
C9orf172C9J069 AC009065.5-201ENST00000565937 596 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
C9orf172C9J069 AC007611.1-201ENST00000568150 826 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
C9orf172C9J069 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
C9orf172C9J069 AC011466.1-201ENST00000595201 566 ntTSL 4 BASIC15.12■□□□□ 0.01
C9orf172C9J069 AC233724.13-201ENST00000598383 410 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
C9orf172C9J069 ABBA01031660.1-201ENST00000635219 756 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
C9orf172C9J069 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
C9orf172C9J069 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
C9orf172C9J069 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
C9orf172C9J069 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
C9orf172C9J069 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
C9orf172C9J069 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
C9orf172C9J069 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
C9orf172C9J069 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
C9orf172C9J069 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
C9orf172C9J069 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
C9orf172C9J069 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
C9orf172C9J069 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
C9orf172C9J069 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
C9orf172C9J069 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
C9orf172C9J069 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
C9orf172C9J069 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.12■□□□□ 0.01
C9orf172C9J069 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
C9orf172C9J069 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
C9orf172C9J069 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
C9orf172C9J069 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
C9orf172C9J069 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
C9orf172C9J069 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
C9orf172C9J069 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
C9orf172C9J069 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
C9orf172C9J069 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
C9orf172C9J069 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
C9orf172C9J069 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
C9orf172C9J069 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
C9orf172C9J069 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
C9orf172C9J069 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
C9orf172C9J069 TCEA2-203ENST00000361317 1427 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
C9orf172C9J069 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
C9orf172C9J069 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
C9orf172C9J069 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
C9orf172C9J069 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
C9orf172C9J069 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
C9orf172C9J069 KRTAP10-2-201ENST00000391621 1149 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
C9orf172C9J069 IFI27L1-201ENST00000393115 674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
C9orf172C9J069 SGK2-207ENST00000426287 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
C9orf172C9J069 AL442647.2-201ENST00000429864 857 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
C9orf172C9J069 AP000345.1-201ENST00000454863 569 ntTSL 4 BASIC15.11■□□□□ 0.01
C9orf172C9J069 NME2-206ENST00000513177 692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
C9orf172C9J069 FLJ27354-203ENST00000526694 851 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
C9orf172C9J069 AC105020.3-201ENST00000566036 560 ntTSL 4 BASIC15.11■□□□□ 0.01
C9orf172C9J069 AC012615.4-201ENST00000586694 607 ntTSL 4 BASIC15.11■□□□□ 0.01
C9orf172C9J069 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
C9orf172C9J069 UVSSA-208ENST00000511563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
C9orf172C9J069 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
C9orf172C9J069 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
C9orf172C9J069 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
C9orf172C9J069 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
C9orf172C9J069 POMP-201ENST00000380842 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
C9orf172C9J069 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
C9orf172C9J069 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
C9orf172C9J069 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
C9orf172C9J069 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
C9orf172C9J069 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
C9orf172C9J069 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
C9orf172C9J069 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
C9orf172C9J069 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
C9orf172C9J069 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
C9orf172C9J069 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
C9orf172C9J069 ENOSF1-209ENST00000580982 1397 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
C9orf172C9J069 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
C9orf172C9J069 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
C9orf172C9J069 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
C9orf172C9J069 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
C9orf172C9J069 KRT8P22-201ENST00000562317 1415 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
C9orf172C9J069 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
C9orf172C9J069 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
C9orf172C9J069 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
C9orf172C9J069 G6PD-203ENST00000393564 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
C9orf172C9J069 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
C9orf172C9J069 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
C9orf172C9J069 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
C9orf172C9J069 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
C9orf172C9J069 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
C9orf172C9J069 FAM86MP-201ENST00000340703 885 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
C9orf172C9J069 RPF1-202ENST00000370656 724 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
C9orf172C9J069 DBNDD2-208ENST00000372723 1118 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
C9orf172C9J069 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
C9orf172C9J069 PHACTR1-202ENST00000379329 707 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
C9orf172C9J069 RABL2A-203ENST00000393166 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms