Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4K3

TRAF6, TNF receptor-associated factor 6, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF6Q9Y4K3 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRAF6Q9Y4K3 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRAF6Q9Y4K3 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRAF6Q9Y4K3 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRAF6Q9Y4K3 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRAF6Q9Y4K3 ARHGAP45-212ENST00000590577 3218 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRAF6Q9Y4K3 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRAF6Q9Y4K3 SYNE3-203ENST00000554873 2826 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRAF6Q9Y4K3 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRAF6Q9Y4K3 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRAF6Q9Y4K3 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRAF6Q9Y4K3 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRAF6Q9Y4K3 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRAF6Q9Y4K3 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRAF6Q9Y4K3 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRAF6Q9Y4K3 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRAF6Q9Y4K3 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRAF6Q9Y4K3 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRAF6Q9Y4K3 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
TRAF6Q9Y4K3 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRAF6Q9Y4K3 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRAF6Q9Y4K3 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
TRAF6Q9Y4K3 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRAF6Q9Y4K3 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
TRAF6Q9Y4K3 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
TRAF6Q9Y4K3 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRAF6Q9Y4K3 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRAF6Q9Y4K3 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRAF6Q9Y4K3 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRAF6Q9Y4K3 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRAF6Q9Y4K3 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRAF6Q9Y4K3 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRAF6Q9Y4K3 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRAF6Q9Y4K3 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRAF6Q9Y4K3 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRAF6Q9Y4K3 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRAF6Q9Y4K3 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRAF6Q9Y4K3 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRAF6Q9Y4K3 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRAF6Q9Y4K3 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRAF6Q9Y4K3 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRAF6Q9Y4K3 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRAF6Q9Y4K3 NEK11-210ENST00000510769 2149 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRAF6Q9Y4K3 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRAF6Q9Y4K3 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRAF6Q9Y4K3 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRAF6Q9Y4K3 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRAF6Q9Y4K3 PPP1R26-206ENST00000605660 4502 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRAF6Q9Y4K3 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRAF6Q9Y4K3 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRAF6Q9Y4K3 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRAF6Q9Y4K3 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRAF6Q9Y4K3 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRAF6Q9Y4K3 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRAF6Q9Y4K3 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRAF6Q9Y4K3 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRAF6Q9Y4K3 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRAF6Q9Y4K3 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRAF6Q9Y4K3 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRAF6Q9Y4K3 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
TRAF6Q9Y4K3 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRAF6Q9Y4K3 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
TRAF6Q9Y4K3 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRAF6Q9Y4K3 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRAF6Q9Y4K3 IMPA1-201ENST00000256108 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRAF6Q9Y4K3 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
TRAF6Q9Y4K3 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRAF6Q9Y4K3 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRAF6Q9Y4K3 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRAF6Q9Y4K3 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRAF6Q9Y4K3 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRAF6Q9Y4K3 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRAF6Q9Y4K3 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRAF6Q9Y4K3 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRAF6Q9Y4K3 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRAF6Q9Y4K3 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRAF6Q9Y4K3 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
TRAF6Q9Y4K3 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRAF6Q9Y4K3 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRAF6Q9Y4K3 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRAF6Q9Y4K3 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRAF6Q9Y4K3 MIR137HG-202ENST00000424528 2639 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRAF6Q9Y4K3 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRAF6Q9Y4K3 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRAF6Q9Y4K3 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRAF6Q9Y4K3 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRAF6Q9Y4K3 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRAF6Q9Y4K3 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRAF6Q9Y4K3 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRAF6Q9Y4K3 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
TRAF6Q9Y4K3 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRAF6Q9Y4K3 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRAF6Q9Y4K3 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRAF6Q9Y4K3 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRAF6Q9Y4K3 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRAF6Q9Y4K3 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRAF6Q9Y4K3 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRAF6Q9Y4K3 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRAF6Q9Y4K3 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRAF6Q9Y4K3 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
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