Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2E6

DTX4, E3 ubiquitin-protein ligase DTX4, humanhuman

Predictions only

Length 619 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DTX4Q9Y2E6 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
DTX4Q9Y2E6 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
DTX4Q9Y2E6 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
DTX4Q9Y2E6 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
DTX4Q9Y2E6 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
DTX4Q9Y2E6 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
DTX4Q9Y2E6 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
DTX4Q9Y2E6 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
DTX4Q9Y2E6 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
DTX4Q9Y2E6 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
DTX4Q9Y2E6 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
DTX4Q9Y2E6 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
DTX4Q9Y2E6 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
DTX4Q9Y2E6 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
DTX4Q9Y2E6 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
DTX4Q9Y2E6 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
DTX4Q9Y2E6 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
DTX4Q9Y2E6 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
DTX4Q9Y2E6 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
DTX4Q9Y2E6 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
DTX4Q9Y2E6 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
DTX4Q9Y2E6 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
DTX4Q9Y2E6 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
DTX4Q9Y2E6 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
DTX4Q9Y2E6 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
DTX4Q9Y2E6 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
DTX4Q9Y2E6 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
DTX4Q9Y2E6 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
DTX4Q9Y2E6 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
DTX4Q9Y2E6 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC15.12■□□□□ 0.01
DTX4Q9Y2E6 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
DTX4Q9Y2E6 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
DTX4Q9Y2E6 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
DTX4Q9Y2E6 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
DTX4Q9Y2E6 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
DTX4Q9Y2E6 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
DTX4Q9Y2E6 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC15.12■□□□□ 0.01
DTX4Q9Y2E6 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
DTX4Q9Y2E6 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
DTX4Q9Y2E6 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
DTX4Q9Y2E6 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
DTX4Q9Y2E6 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
DTX4Q9Y2E6 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
DTX4Q9Y2E6 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
DTX4Q9Y2E6 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
DTX4Q9Y2E6 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
DTX4Q9Y2E6 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
DTX4Q9Y2E6 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
DTX4Q9Y2E6 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC15.11■□□□□ 0.01
DTX4Q9Y2E6 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
DTX4Q9Y2E6 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
DTX4Q9Y2E6 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
DTX4Q9Y2E6 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
DTX4Q9Y2E6 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
DTX4Q9Y2E6 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
DTX4Q9Y2E6 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
DTX4Q9Y2E6 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
DTX4Q9Y2E6 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
DTX4Q9Y2E6 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
DTX4Q9Y2E6 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
DTX4Q9Y2E6 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
DTX4Q9Y2E6 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
DTX4Q9Y2E6 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
DTX4Q9Y2E6 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
DTX4Q9Y2E6 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
DTX4Q9Y2E6 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
DTX4Q9Y2E6 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
DTX4Q9Y2E6 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
DTX4Q9Y2E6 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
DTX4Q9Y2E6 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
DTX4Q9Y2E6 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
DTX4Q9Y2E6 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
DTX4Q9Y2E6 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
DTX4Q9Y2E6 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
DTX4Q9Y2E6 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
DTX4Q9Y2E6 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
DTX4Q9Y2E6 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
DTX4Q9Y2E6 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
DTX4Q9Y2E6 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
DTX4Q9Y2E6 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
DTX4Q9Y2E6 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
DTX4Q9Y2E6 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
DTX4Q9Y2E6 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
DTX4Q9Y2E6 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
DTX4Q9Y2E6 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
DTX4Q9Y2E6 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
DTX4Q9Y2E6 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
DTX4Q9Y2E6 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
DTX4Q9Y2E6 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
DTX4Q9Y2E6 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
DTX4Q9Y2E6 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
DTX4Q9Y2E6 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
DTX4Q9Y2E6 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
DTX4Q9Y2E6 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
DTX4Q9Y2E6 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
DTX4Q9Y2E6 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
DTX4Q9Y2E6 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
DTX4Q9Y2E6 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
DTX4Q9Y2E6 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
DTX4Q9Y2E6 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms