Protein–RNA interactions for Protein: Q9UP95

SLC12A4, Solute carrier family 12 member 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,085 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC12A4Q9UP95 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC12A4Q9UP95 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC12A4Q9UP95 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC12A4Q9UP95 BRCC3-201ENST00000330045 2496 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC12A4Q9UP95 HDAC11-201ENST00000295757 2960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC12A4Q9UP95 CNOT9-208ENST00000542068 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC12A4Q9UP95 TMCC2-202ENST00000330675 2780 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC12A4Q9UP95 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC12A4Q9UP95 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC12A4Q9UP95 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC12A4Q9UP95 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC12A4Q9UP95 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC12A4Q9UP95 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC12A4Q9UP95 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC12A4Q9UP95 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC12A4Q9UP95 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC12A4Q9UP95 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC12A4Q9UP95 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC12A4Q9UP95 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC12A4Q9UP95 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC12A4Q9UP95 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC12A4Q9UP95 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC12A4Q9UP95 RAF1-205ENST00000442415 3085 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC12A4Q9UP95 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC12A4Q9UP95 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC12A4Q9UP95 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC12A4Q9UP95 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC12A4Q9UP95 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC12A4Q9UP95 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC12A4Q9UP95 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC12A4Q9UP95 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC12A4Q9UP95 FAM219A-204ENST00000379081 3543 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC12A4Q9UP95 ZNF84-215ENST00000543758 3501 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC12A4Q9UP95 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC12A4Q9UP95 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC12A4Q9UP95 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC12A4Q9UP95 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC12A4Q9UP95 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC12A4Q9UP95 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC12A4Q9UP95 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC12A4Q9UP95 TMEM189-203ENST00000371656 1973 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC12A4Q9UP95 XRCC1-201ENST00000262887 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC12A4Q9UP95 RPH3AL-201ENST00000323434 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC12A4Q9UP95 CCAR2-202ENST00000389279 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC12A4Q9UP95 ARIH2-205ENST00000449376 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC12A4Q9UP95 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC12A4Q9UP95 ZNF208-205ENST00000601773 2027 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC12A4Q9UP95 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC12A4Q9UP95 POLR2B-205ENST00000441246 3839 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC12A4Q9UP95 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC12A4Q9UP95 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC12A4Q9UP95 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC12A4Q9UP95 TMPRSS3-204ENST00000433957 2403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC12A4Q9UP95 LINC02212-201ENST00000515243 2130 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC12A4Q9UP95 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC12A4Q9UP95 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC12A4Q9UP95 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC12A4Q9UP95 EPOP-201ENST00000621654 3719 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC12A4Q9UP95 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC12A4Q9UP95 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC12A4Q9UP95 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC12A4Q9UP95 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC12A4Q9UP95 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC12A4Q9UP95 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC12A4Q9UP95 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC12A4Q9UP95 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC12A4Q9UP95 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC12A4Q9UP95 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC12A4Q9UP95 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC12A4Q9UP95 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC12A4Q9UP95 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC12A4Q9UP95 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC12A4Q9UP95 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC12A4Q9UP95 MIER1-208ENST00000401041 2552 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC12A4Q9UP95 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC12A4Q9UP95 GRAP-201ENST00000284154 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC12A4Q9UP95 CDH20-203ENST00000538374 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC12A4Q9UP95 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC12A4Q9UP95 EPHX2-209ENST00000521780 2038 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC12A4Q9UP95 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC12A4Q9UP95 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC12A4Q9UP95 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC12A4Q9UP95 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC12A4Q9UP95 MFSD13A-201ENST00000238936 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC12A4Q9UP95 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC12A4Q9UP95 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SLC12A4Q9UP95 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SLC12A4Q9UP95 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SLC12A4Q9UP95 PCDHGB1-202ENST00000611598 2592 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SLC12A4Q9UP95 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SLC12A4Q9UP95 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
SLC12A4Q9UP95 ZNF557-201ENST00000252840 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SLC12A4Q9UP95 AL139082.1-201ENST00000613982 3433 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SLC12A4Q9UP95 ENDOV-213ENST00000520367 2680 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SLC12A4Q9UP95 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SLC12A4Q9UP95 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SLC12A4Q9UP95 CICP23-201ENST00000605013 2741 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
SLC12A4Q9UP95 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SLC12A4Q9UP95 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SLC12A4Q9UP95 PPP1R26-206ENST00000605660 4502 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.6 ms