Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNS2

COPS3, COP9 signalosome complex subunit 3, humanhuman

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Length 423 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS3Q9UNS2 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
COPS3Q9UNS2 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
COPS3Q9UNS2 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
COPS3Q9UNS2 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
COPS3Q9UNS2 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
COPS3Q9UNS2 BCL11A-203ENST00000358510 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
COPS3Q9UNS2 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
COPS3Q9UNS2 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
COPS3Q9UNS2 FZD4-201ENST00000531380 7383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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COPS3Q9UNS2 SLC6A11-201ENST00000254488 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
COPS3Q9UNS2 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
COPS3Q9UNS2 SOWAHA-201ENST00000378693 3211 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
COPS3Q9UNS2 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
COPS3Q9UNS2 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
COPS3Q9UNS2 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
COPS3Q9UNS2 AAK1-202ENST00000409068 2606 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
COPS3Q9UNS2 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
COPS3Q9UNS2 PAPOLA-223ENST00000557320 3264 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
COPS3Q9UNS2 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
COPS3Q9UNS2 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
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COPS3Q9UNS2 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
COPS3Q9UNS2 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
COPS3Q9UNS2 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
COPS3Q9UNS2 CYP4X1-201ENST00000371901 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
COPS3Q9UNS2 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
COPS3Q9UNS2 AC010931.2-202ENST00000514871 2566 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
COPS3Q9UNS2 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
COPS3Q9UNS2 KCNQ2-204ENST00000359125 3253 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
COPS3Q9UNS2 KIFC3-205ENST00000540079 2781 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
COPS3Q9UNS2 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
COPS3Q9UNS2 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
COPS3Q9UNS2 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
COPS3Q9UNS2 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
COPS3Q9UNS2 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
COPS3Q9UNS2 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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COPS3Q9UNS2 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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COPS3Q9UNS2 ME2-201ENST00000321341 9415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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COPS3Q9UNS2 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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COPS3Q9UNS2 AC104581.4-201ENST00000623126 3052 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
COPS3Q9UNS2 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
COPS3Q9UNS2 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
COPS3Q9UNS2 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
COPS3Q9UNS2 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
COPS3Q9UNS2 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
COPS3Q9UNS2 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
COPS3Q9UNS2 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
COPS3Q9UNS2 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
COPS3Q9UNS2 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
COPS3Q9UNS2 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
COPS3Q9UNS2 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
COPS3Q9UNS2 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
COPS3Q9UNS2 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
COPS3Q9UNS2 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
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COPS3Q9UNS2 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
COPS3Q9UNS2 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
COPS3Q9UNS2 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
COPS3Q9UNS2 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
COPS3Q9UNS2 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
COPS3Q9UNS2 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
COPS3Q9UNS2 AC021683.3-202ENST00000592572 4440 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
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