Protein–RNA interactions for Protein: Q9UL40

ZNF346, Zinc finger protein 346, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 294 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF346Q9UL40 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
ZNF346Q9UL40 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
ZNF346Q9UL40 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
ZNF346Q9UL40 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
ZNF346Q9UL40 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
ZNF346Q9UL40 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
ZNF346Q9UL40 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
ZNF346Q9UL40 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
ZNF346Q9UL40 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
ZNF346Q9UL40 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
ZNF346Q9UL40 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
ZNF346Q9UL40 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
ZNF346Q9UL40 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
ZNF346Q9UL40 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
ZNF346Q9UL40 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
ZNF346Q9UL40 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
ZNF346Q9UL40 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
ZNF346Q9UL40 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
ZNF346Q9UL40 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
ZNF346Q9UL40 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
ZNF346Q9UL40 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
ZNF346Q9UL40 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
ZNF346Q9UL40 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
ZNF346Q9UL40 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
ZNF346Q9UL40 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
ZNF346Q9UL40 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
ZNF346Q9UL40 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
ZNF346Q9UL40 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
ZNF346Q9UL40 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
ZNF346Q9UL40 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
ZNF346Q9UL40 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
ZNF346Q9UL40 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
ZNF346Q9UL40 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
ZNF346Q9UL40 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
ZNF346Q9UL40 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
ZNF346Q9UL40 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ZNF346Q9UL40 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
ZNF346Q9UL40 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
ZNF346Q9UL40 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
ZNF346Q9UL40 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ZNF346Q9UL40 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
ZNF346Q9UL40 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ZNF346Q9UL40 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
ZNF346Q9UL40 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ZNF346Q9UL40 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ZNF346Q9UL40 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ZNF346Q9UL40 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ZNF346Q9UL40 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ZNF346Q9UL40 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC14.72□□□□□ -0.05
ZNF346Q9UL40 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ZNF346Q9UL40 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ZNF346Q9UL40 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
ZNF346Q9UL40 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ZNF346Q9UL40 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
ZNF346Q9UL40 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
ZNF346Q9UL40 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
ZNF346Q9UL40 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ZNF346Q9UL40 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ZNF346Q9UL40 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ZNF346Q9UL40 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ZNF346Q9UL40 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
ZNF346Q9UL40 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
ZNF346Q9UL40 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
ZNF346Q9UL40 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
ZNF346Q9UL40 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ZNF346Q9UL40 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
ZNF346Q9UL40 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
ZNF346Q9UL40 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
ZNF346Q9UL40 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
ZNF346Q9UL40 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
ZNF346Q9UL40 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ZNF346Q9UL40 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
ZNF346Q9UL40 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ZNF346Q9UL40 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
ZNF346Q9UL40 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
ZNF346Q9UL40 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ZNF346Q9UL40 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
ZNF346Q9UL40 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ZNF346Q9UL40 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ZNF346Q9UL40 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ZNF346Q9UL40 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ZNF346Q9UL40 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ZNF346Q9UL40 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ZNF346Q9UL40 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ZNF346Q9UL40 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
ZNF346Q9UL40 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
ZNF346Q9UL40 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
ZNF346Q9UL40 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ZNF346Q9UL40 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
ZNF346Q9UL40 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
ZNF346Q9UL40 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
ZNF346Q9UL40 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
ZNF346Q9UL40 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
ZNF346Q9UL40 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
ZNF346Q9UL40 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
ZNF346Q9UL40 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
ZNF346Q9UL40 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
ZNF346Q9UL40 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
ZNF346Q9UL40 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
ZNF346Q9UL40 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
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