Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBX1

CTSF, Cathepsin F, humanhuman

Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTSFQ9UBX1 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CTSFQ9UBX1 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CTSFQ9UBX1 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CTSFQ9UBX1 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CTSFQ9UBX1 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CTSFQ9UBX1 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CTSFQ9UBX1 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CTSFQ9UBX1 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CTSFQ9UBX1 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CTSFQ9UBX1 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CTSFQ9UBX1 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CTSFQ9UBX1 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CTSFQ9UBX1 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CTSFQ9UBX1 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CTSFQ9UBX1 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CTSFQ9UBX1 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CTSFQ9UBX1 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CTSFQ9UBX1 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CTSFQ9UBX1 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CTSFQ9UBX1 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CTSFQ9UBX1 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CTSFQ9UBX1 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CTSFQ9UBX1 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CTSFQ9UBX1 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CTSFQ9UBX1 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CTSFQ9UBX1 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CTSFQ9UBX1 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CTSFQ9UBX1 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CTSFQ9UBX1 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CTSFQ9UBX1 EIF5A-201ENST00000336452 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CTSFQ9UBX1 C1orf43-203ENST00000368516 872 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CTSFQ9UBX1 CALY-203ENST00000368558 825 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CTSFQ9UBX1 ZSCAN2-205ENST00000379358 906 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CTSFQ9UBX1 HNRNPA1P40-201ENST00000426371 1278 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CTSFQ9UBX1 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CTSFQ9UBX1 AL512638.1-201ENST00000457493 794 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CTSFQ9UBX1 LHX6-205ENST00000464484 666 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CTSFQ9UBX1 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CTSFQ9UBX1 LMO7-AS1-202ENST00000568735 467 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CTSFQ9UBX1 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CTSFQ9UBX1 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CTSFQ9UBX1 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CTSFQ9UBX1 AC010507.1-202ENST00000633286 381 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CTSFQ9UBX1 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CTSFQ9UBX1 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CTSFQ9UBX1 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CTSFQ9UBX1 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CTSFQ9UBX1 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CTSFQ9UBX1 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CTSFQ9UBX1 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CTSFQ9UBX1 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CTSFQ9UBX1 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CTSFQ9UBX1 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CTSFQ9UBX1 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CTSFQ9UBX1 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CTSFQ9UBX1 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
CTSFQ9UBX1 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CTSFQ9UBX1 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CTSFQ9UBX1 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CTSFQ9UBX1 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
CTSFQ9UBX1 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
CTSFQ9UBX1 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CTSFQ9UBX1 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
CTSFQ9UBX1 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CTSFQ9UBX1 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
CTSFQ9UBX1 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
CTSFQ9UBX1 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CTSFQ9UBX1 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
CTSFQ9UBX1 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CTSFQ9UBX1 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CTSFQ9UBX1 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CTSFQ9UBX1 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CTSFQ9UBX1 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CTSFQ9UBX1 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CTSFQ9UBX1 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CTSFQ9UBX1 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CTSFQ9UBX1 TMEM41A-201ENST00000296254 1060 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CTSFQ9UBX1 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CTSFQ9UBX1 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CTSFQ9UBX1 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CTSFQ9UBX1 GREM1-201ENST00000560677 623 ntTSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CTSFQ9UBX1 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CTSFQ9UBX1 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
CTSFQ9UBX1 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
CTSFQ9UBX1 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CTSFQ9UBX1 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CTSFQ9UBX1 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CTSFQ9UBX1 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CTSFQ9UBX1 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CTSFQ9UBX1 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CTSFQ9UBX1 TM2D3-207ENST00000559107 1353 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CTSFQ9UBX1 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CTSFQ9UBX1 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CTSFQ9UBX1 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CTSFQ9UBX1 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CTSFQ9UBX1 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
CTSFQ9UBX1 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CTSFQ9UBX1 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CTSFQ9UBX1 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CTSFQ9UBX1 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.4 ms