Protein–RNA interactions for Protein: Q9NWW5

CLN6, Ceroid-lipofuscinosis neuronal protein 6, humanhuman

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Length 311 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN6Q9NWW5 MIR137HG-202ENST00000424528 2639 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
CLN6Q9NWW5 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CLN6Q9NWW5 CASC3-201ENST00000264645 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CLN6Q9NWW5 PA2G4-201ENST00000303305 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CLN6Q9NWW5 EXO5-203ENST00000372703 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
CLN6Q9NWW5 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
CLN6Q9NWW5 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CLN6Q9NWW5 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
CLN6Q9NWW5 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CLN6Q9NWW5 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CLN6Q9NWW5 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
CLN6Q9NWW5 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CLN6Q9NWW5 FAM8A1-201ENST00000259963 4677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CLN6Q9NWW5 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
CLN6Q9NWW5 SEC16A-202ENST00000290037 8982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CLN6Q9NWW5 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
CLN6Q9NWW5 TMEM200C-202ENST00000581347 10638 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
CLN6Q9NWW5 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
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CLN6Q9NWW5 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
CLN6Q9NWW5 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
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CLN6Q9NWW5 UROC1-202ENST00000383579 2735 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CLN6Q9NWW5 SLC4A2-202ENST00000413384 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CLN6Q9NWW5 TOB2-201ENST00000327492 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
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CLN6Q9NWW5 KRT8-205ENST00000546897 1755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
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CLN6Q9NWW5 PHLDA1-201ENST00000266671 8069 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
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CLN6Q9NWW5 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CLN6Q9NWW5 MMP25-201ENST00000336577 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
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CLN6Q9NWW5 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
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CLN6Q9NWW5 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
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CLN6Q9NWW5 AC010931.2-202ENST00000514871 2566 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
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CLN6Q9NWW5 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
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CLN6Q9NWW5 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
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CLN6Q9NWW5 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CLN6Q9NWW5 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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CLN6Q9NWW5 ITGB7-201ENST00000267082 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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CLN6Q9NWW5 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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CLN6Q9NWW5 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CLN6Q9NWW5 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CLN6Q9NWW5 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CLN6Q9NWW5 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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CLN6Q9NWW5 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
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CLN6Q9NWW5 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CLN6Q9NWW5 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
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CLN6Q9NWW5 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
CLN6Q9NWW5 AP4E1-201ENST00000261842 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CLN6Q9NWW5 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CLN6Q9NWW5 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CLN6Q9NWW5 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CLN6Q9NWW5 STK17B-201ENST00000263955 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CLN6Q9NWW5 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CLN6Q9NWW5 DTNB-228ENST00000496972 2328 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CLN6Q9NWW5 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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