Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRS6

SNX15, Sorting nexin-15, humanhuman

Predictions only

Length 342 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX15Q9NRS6 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SNX15Q9NRS6 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
SNX15Q9NRS6 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
SNX15Q9NRS6 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
SNX15Q9NRS6 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
SNX15Q9NRS6 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SNX15Q9NRS6 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
SNX15Q9NRS6 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SNX15Q9NRS6 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SNX15Q9NRS6 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SNX15Q9NRS6 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SNX15Q9NRS6 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
SNX15Q9NRS6 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
SNX15Q9NRS6 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
SNX15Q9NRS6 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SNX15Q9NRS6 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
SNX15Q9NRS6 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
SNX15Q9NRS6 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SNX15Q9NRS6 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SNX15Q9NRS6 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SNX15Q9NRS6 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SNX15Q9NRS6 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SNX15Q9NRS6 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
SNX15Q9NRS6 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SNX15Q9NRS6 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SNX15Q9NRS6 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SNX15Q9NRS6 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SNX15Q9NRS6 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SNX15Q9NRS6 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SNX15Q9NRS6 NEK11-210ENST00000510769 2149 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SNX15Q9NRS6 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SNX15Q9NRS6 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SNX15Q9NRS6 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SNX15Q9NRS6 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SNX15Q9NRS6 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SNX15Q9NRS6 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SNX15Q9NRS6 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SNX15Q9NRS6 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SNX15Q9NRS6 SLC12A5-209ENST00000616201 2955 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SNX15Q9NRS6 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SNX15Q9NRS6 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SNX15Q9NRS6 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SNX15Q9NRS6 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SNX15Q9NRS6 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SNX15Q9NRS6 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SNX15Q9NRS6 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SNX15Q9NRS6 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
SNX15Q9NRS6 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SNX15Q9NRS6 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SNX15Q9NRS6 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
SNX15Q9NRS6 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SNX15Q9NRS6 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SNX15Q9NRS6 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SNX15Q9NRS6 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SNX15Q9NRS6 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SNX15Q9NRS6 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SNX15Q9NRS6 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SNX15Q9NRS6 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SNX15Q9NRS6 ARHGAP45-212ENST00000590577 3218 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SNX15Q9NRS6 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SNX15Q9NRS6 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SNX15Q9NRS6 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SNX15Q9NRS6 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SNX15Q9NRS6 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SNX15Q9NRS6 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
SNX15Q9NRS6 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SNX15Q9NRS6 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
SNX15Q9NRS6 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SNX15Q9NRS6 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SNX15Q9NRS6 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SNX15Q9NRS6 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SNX15Q9NRS6 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SNX15Q9NRS6 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SNX15Q9NRS6 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SNX15Q9NRS6 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SNX15Q9NRS6 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SNX15Q9NRS6 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SNX15Q9NRS6 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SNX15Q9NRS6 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SNX15Q9NRS6 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SNX15Q9NRS6 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SNX15Q9NRS6 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SNX15Q9NRS6 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SNX15Q9NRS6 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SNX15Q9NRS6 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
SNX15Q9NRS6 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SNX15Q9NRS6 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SNX15Q9NRS6 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SNX15Q9NRS6 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SNX15Q9NRS6 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
SNX15Q9NRS6 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SNX15Q9NRS6 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SNX15Q9NRS6 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SNX15Q9NRS6 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SNX15Q9NRS6 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SNX15Q9NRS6 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SNX15Q9NRS6 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SNX15Q9NRS6 TNFRSF14-AS1-202ENST00000432521 3608 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SNX15Q9NRS6 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SNX15Q9NRS6 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.9 ms