Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRB3

CHST12, Carbohydrate sulfotransferase 12, humanhuman

Predictions only

Length 414 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHST12Q9NRB3 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CHST12Q9NRB3 TEKT2-201ENST00000207457 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CHST12Q9NRB3 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CHST12Q9NRB3 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
CHST12Q9NRB3 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CHST12Q9NRB3 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CHST12Q9NRB3 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CHST12Q9NRB3 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CHST12Q9NRB3 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CHST12Q9NRB3 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CHST12Q9NRB3 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CHST12Q9NRB3 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CHST12Q9NRB3 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CHST12Q9NRB3 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CHST12Q9NRB3 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CHST12Q9NRB3 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CHST12Q9NRB3 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CHST12Q9NRB3 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CHST12Q9NRB3 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CHST12Q9NRB3 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CHST12Q9NRB3 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CHST12Q9NRB3 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CHST12Q9NRB3 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CHST12Q9NRB3 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CHST12Q9NRB3 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CHST12Q9NRB3 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CHST12Q9NRB3 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CHST12Q9NRB3 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CHST12Q9NRB3 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CHST12Q9NRB3 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CHST12Q9NRB3 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CHST12Q9NRB3 CU639417.3-201ENST00000624240 1404 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
CHST12Q9NRB3 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CHST12Q9NRB3 VCX2-201ENST00000317103 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CHST12Q9NRB3 CIDEA-201ENST00000320477 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CHST12Q9NRB3 ACTA1-201ENST00000366683 1122 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CHST12Q9NRB3 STMN1-204ENST00000426559 948 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CHST12Q9NRB3 AC092910.3-202ENST00000469070 982 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CHST12Q9NRB3 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CHST12Q9NRB3 RHBDL2-203ENST00000540558 697 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CHST12Q9NRB3 LINC01975-201ENST00000571890 549 ntTSL 4 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CHST12Q9NRB3 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CHST12Q9NRB3 SRD5A3P1-201ENST00000603021 949 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
CHST12Q9NRB3 DUSP13-214ENST00000607131 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CHST12Q9NRB3 VCX-203ENST00000620630 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CHST12Q9NRB3 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CHST12Q9NRB3 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CHST12Q9NRB3 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CHST12Q9NRB3 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CHST12Q9NRB3 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
CHST12Q9NRB3 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CHST12Q9NRB3 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
CHST12Q9NRB3 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CHST12Q9NRB3 AC104407.1-201ENST00000511017 1568 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.41
CHST12Q9NRB3 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
CHST12Q9NRB3 VASH1-203ENST00000554237 1462 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CHST12Q9NRB3 TDH-201ENST00000525246 1357 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CHST12Q9NRB3 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CHST12Q9NRB3 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CHST12Q9NRB3 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CHST12Q9NRB3 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CHST12Q9NRB3 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CHST12Q9NRB3 H2BFWT-201ENST00000217926 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CHST12Q9NRB3 SPDYE19P-201ENST00000338590 713 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
CHST12Q9NRB3 LINC01116-202ENST00000339037 838 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CHST12Q9NRB3 COX5BP8-201ENST00000416911 349 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
CHST12Q9NRB3 VAT1-202ENST00000420567 1069 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CHST12Q9NRB3 MEP1AP4-201ENST00000423244 1087 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
CHST12Q9NRB3 LINC00229-201ENST00000443783 500 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CHST12Q9NRB3 PTK7-212ENST00000476760 902 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CHST12Q9NRB3 RPL10P19-202ENST00000520582 722 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CHST12Q9NRB3 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CHST12Q9NRB3 AP003068.1-201ENST00000528887 544 ntTSL 4 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CHST12Q9NRB3 YEATS4-202ENST00000548020 1100 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CHST12Q9NRB3 AL928654.4-206ENST00000551180 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CHST12Q9NRB3 IL32-234ENST00000552936 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CHST12Q9NRB3 AC243562.3-201ENST00000559866 1212 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CHST12Q9NRB3 AP005482.2-201ENST00000587889 310 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CHST12Q9NRB3 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CHST12Q9NRB3 ALDH3B1-203ENST00000612297 1231 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CHST12Q9NRB3 AC004461.2-201ENST00000629517 803 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
CHST12Q9NRB3 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CHST12Q9NRB3 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CHST12Q9NRB3 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CHST12Q9NRB3 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CHST12Q9NRB3 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CHST12Q9NRB3 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CHST12Q9NRB3 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CHST12Q9NRB3 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CHST12Q9NRB3 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CHST12Q9NRB3 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
CHST12Q9NRB3 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CHST12Q9NRB3 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CHST12Q9NRB3 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CHST12Q9NRB3 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CHST12Q9NRB3 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CHST12Q9NRB3 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CHST12Q9NRB3 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CHST12Q9NRB3 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CHST12Q9NRB3 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65 ms