Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRA0

SPHK2, Sphingosine kinase 2, humanhuman

Predictions only

Length 654 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPHK2Q9NRA0 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SPHK2Q9NRA0 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SPHK2Q9NRA0 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SPHK2Q9NRA0 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SPHK2Q9NRA0 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SPHK2Q9NRA0 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SPHK2Q9NRA0 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SPHK2Q9NRA0 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SPHK2Q9NRA0 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SPHK2Q9NRA0 TEKT2-201ENST00000207457 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SPHK2Q9NRA0 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SPHK2Q9NRA0 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SPHK2Q9NRA0 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SPHK2Q9NRA0 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SPHK2Q9NRA0 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SPHK2Q9NRA0 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SPHK2Q9NRA0 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
SPHK2Q9NRA0 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SPHK2Q9NRA0 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SPHK2Q9NRA0 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SPHK2Q9NRA0 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SPHK2Q9NRA0 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SPHK2Q9NRA0 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SPHK2Q9NRA0 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SPHK2Q9NRA0 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SPHK2Q9NRA0 NDUFA2-201ENST00000252102 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SPHK2Q9NRA0 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SPHK2Q9NRA0 CCL25-203ENST00000390669 924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SPHK2Q9NRA0 COX5BP8-201ENST00000416911 349 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
SPHK2Q9NRA0 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
SPHK2Q9NRA0 LINC00473-201ENST00000444465 798 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SPHK2Q9NRA0 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
SPHK2Q9NRA0 CD81-207ENST00000481687 890 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SPHK2Q9NRA0 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SPHK2Q9NRA0 LEPROTL1-204ENST00000518192 847 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SPHK2Q9NRA0 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SPHK2Q9NRA0 YEATS4-202ENST00000548020 1100 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SPHK2Q9NRA0 PIMREG-202ENST00000570337 891 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SPHK2Q9NRA0 PIMREG-203ENST00000571373 1002 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SPHK2Q9NRA0 AP005482.2-201ENST00000587889 310 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SPHK2Q9NRA0 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SPHK2Q9NRA0 FAM66A-202ENST00000602658 546 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SPHK2Q9NRA0 SNHG28-203ENST00000621242 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SPHK2Q9NRA0 ZNF655-225ENST00000626122 705 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SPHK2Q9NRA0 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SPHK2Q9NRA0 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SPHK2Q9NRA0 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SPHK2Q9NRA0 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SPHK2Q9NRA0 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SPHK2Q9NRA0 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SPHK2Q9NRA0 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SPHK2Q9NRA0 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SPHK2Q9NRA0 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SPHK2Q9NRA0 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SPHK2Q9NRA0 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SPHK2Q9NRA0 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SPHK2Q9NRA0 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
SPHK2Q9NRA0 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SPHK2Q9NRA0 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SPHK2Q9NRA0 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SPHK2Q9NRA0 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SPHK2Q9NRA0 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SPHK2Q9NRA0 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SPHK2Q9NRA0 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SPHK2Q9NRA0 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SPHK2Q9NRA0 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SPHK2Q9NRA0 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
SPHK2Q9NRA0 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SPHK2Q9NRA0 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SPHK2Q9NRA0 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SPHK2Q9NRA0 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SPHK2Q9NRA0 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
SPHK2Q9NRA0 RPS5-201ENST00000196551 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SPHK2Q9NRA0 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SPHK2Q9NRA0 FIBP-201ENST00000338369 1261 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SPHK2Q9NRA0 TSPAN4-201ENST00000346501 882 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SPHK2Q9NRA0 CYB561D1-202ENST00000369868 1085 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SPHK2Q9NRA0 AC004987.2-201ENST00000395959 1148 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
SPHK2Q9NRA0 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SPHK2Q9NRA0 RAD18-204ENST00000418463 563 ntTSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SPHK2Q9NRA0 RAD18-205ENST00000421052 582 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SPHK2Q9NRA0 RPSAP31-202ENST00000445165 716 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SPHK2Q9NRA0 NEIL2-207ENST00000528323 998 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SPHK2Q9NRA0 AP003068.1-201ENST00000528887 544 ntTSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SPHK2Q9NRA0 SLC8B1-206ENST00000549069 1058 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SPHK2Q9NRA0 ARL16-202ENST00000570561 768 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SPHK2Q9NRA0 ALDH3B1-203ENST00000612297 1231 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SPHK2Q9NRA0 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SPHK2Q9NRA0 IFI27-210ENST00000616764 716 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SPHK2Q9NRA0 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SPHK2Q9NRA0 IDH3G-204ENST00000427365 1526 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SPHK2Q9NRA0 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SPHK2Q9NRA0 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SPHK2Q9NRA0 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SPHK2Q9NRA0 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SPHK2Q9NRA0 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SPHK2Q9NRA0 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SPHK2Q9NRA0 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SPHK2Q9NRA0 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SPHK2Q9NRA0 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms