Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPC4

A4GALT, Lactosylceramide 4-alpha-galactosyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 353 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A4GALTQ9NPC4 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
A4GALTQ9NPC4 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
A4GALTQ9NPC4 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
A4GALTQ9NPC4 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
A4GALTQ9NPC4 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
A4GALTQ9NPC4 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
A4GALTQ9NPC4 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
A4GALTQ9NPC4 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
A4GALTQ9NPC4 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
A4GALTQ9NPC4 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
A4GALTQ9NPC4 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
A4GALTQ9NPC4 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
A4GALTQ9NPC4 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
A4GALTQ9NPC4 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
A4GALTQ9NPC4 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
A4GALTQ9NPC4 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
A4GALTQ9NPC4 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
A4GALTQ9NPC4 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
A4GALTQ9NPC4 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
A4GALTQ9NPC4 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
A4GALTQ9NPC4 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
A4GALTQ9NPC4 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
A4GALTQ9NPC4 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
A4GALTQ9NPC4 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
A4GALTQ9NPC4 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
A4GALTQ9NPC4 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
A4GALTQ9NPC4 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
A4GALTQ9NPC4 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
A4GALTQ9NPC4 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
A4GALTQ9NPC4 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
A4GALTQ9NPC4 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
A4GALTQ9NPC4 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
A4GALTQ9NPC4 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
A4GALTQ9NPC4 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
A4GALTQ9NPC4 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
A4GALTQ9NPC4 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
A4GALTQ9NPC4 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
A4GALTQ9NPC4 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
A4GALTQ9NPC4 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
A4GALTQ9NPC4 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
A4GALTQ9NPC4 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
A4GALTQ9NPC4 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
A4GALTQ9NPC4 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
A4GALTQ9NPC4 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
A4GALTQ9NPC4 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
A4GALTQ9NPC4 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
A4GALTQ9NPC4 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
A4GALTQ9NPC4 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
A4GALTQ9NPC4 ARHGAP45-212ENST00000590577 3218 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
A4GALTQ9NPC4 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
A4GALTQ9NPC4 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
A4GALTQ9NPC4 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
A4GALTQ9NPC4 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
A4GALTQ9NPC4 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
A4GALTQ9NPC4 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
A4GALTQ9NPC4 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
A4GALTQ9NPC4 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
A4GALTQ9NPC4 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
A4GALTQ9NPC4 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
A4GALTQ9NPC4 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
A4GALTQ9NPC4 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
A4GALTQ9NPC4 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
A4GALTQ9NPC4 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
A4GALTQ9NPC4 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
A4GALTQ9NPC4 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
A4GALTQ9NPC4 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
A4GALTQ9NPC4 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
A4GALTQ9NPC4 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
A4GALTQ9NPC4 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
A4GALTQ9NPC4 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
A4GALTQ9NPC4 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
A4GALTQ9NPC4 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
A4GALTQ9NPC4 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
A4GALTQ9NPC4 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
A4GALTQ9NPC4 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC15.14■□□□□ 0.01
A4GALTQ9NPC4 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC15.14■□□□□ 0.01
A4GALTQ9NPC4 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
A4GALTQ9NPC4 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
A4GALTQ9NPC4 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
A4GALTQ9NPC4 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
A4GALTQ9NPC4 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
A4GALTQ9NPC4 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
A4GALTQ9NPC4 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
A4GALTQ9NPC4 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
A4GALTQ9NPC4 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
A4GALTQ9NPC4 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
A4GALTQ9NPC4 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
A4GALTQ9NPC4 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
A4GALTQ9NPC4 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
A4GALTQ9NPC4 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
A4GALTQ9NPC4 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
A4GALTQ9NPC4 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
A4GALTQ9NPC4 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
A4GALTQ9NPC4 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
A4GALTQ9NPC4 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
A4GALTQ9NPC4 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
A4GALTQ9NPC4 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
A4GALTQ9NPC4 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
A4GALTQ9NPC4 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
A4GALTQ9NPC4 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.2 ms