Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0C6

CIPC, CLOCK-interacting pacemaker, humanhuman

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Length 399 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CIPCQ9C0C6 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CIPCQ9C0C6 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CIPCQ9C0C6 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CIPCQ9C0C6 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CIPCQ9C0C6 IFT20-202ENST00000357896 974 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CIPCQ9C0C6 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CIPCQ9C0C6 MIR661-201ENST00000384842 89 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
CIPCQ9C0C6 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CIPCQ9C0C6 AC004890.2-204ENST00000481968 304 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
CIPCQ9C0C6 AC106795.3-201ENST00000511650 547 ntTSL 4 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CIPCQ9C0C6 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CIPCQ9C0C6 POLD4-211ENST00000539074 714 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CIPCQ9C0C6 AC015712.4-202ENST00000558641 1007 ntTSL 4 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CIPCQ9C0C6 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
CIPCQ9C0C6 SNHG8-201ENST00000602414 672 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CIPCQ9C0C6 SNHG8-205ENST00000602819 470 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CIPCQ9C0C6 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CIPCQ9C0C6 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CIPCQ9C0C6 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CIPCQ9C0C6 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CIPCQ9C0C6 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CIPCQ9C0C6 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CIPCQ9C0C6 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CIPCQ9C0C6 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CIPCQ9C0C6 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CIPCQ9C0C6 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
CIPCQ9C0C6 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CIPCQ9C0C6 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CIPCQ9C0C6 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CIPCQ9C0C6 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CIPCQ9C0C6 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CIPCQ9C0C6 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CIPCQ9C0C6 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CIPCQ9C0C6 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CIPCQ9C0C6 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CIPCQ9C0C6 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CIPCQ9C0C6 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CIPCQ9C0C6 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CIPCQ9C0C6 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CIPCQ9C0C6 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CIPCQ9C0C6 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CIPCQ9C0C6 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CIPCQ9C0C6 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CIPCQ9C0C6 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CIPCQ9C0C6 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CIPCQ9C0C6 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CIPCQ9C0C6 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CIPCQ9C0C6 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CIPCQ9C0C6 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CIPCQ9C0C6 RCAN3-204ENST00000425530 997 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CIPCQ9C0C6 LINC01160-202ENST00000450155 894 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CIPCQ9C0C6 AL359815.1-201ENST00000457706 821 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CIPCQ9C0C6 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CIPCQ9C0C6 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CIPCQ9C0C6 LINC02560-201ENST00000596379 459 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
CIPCQ9C0C6 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CIPCQ9C0C6 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CIPCQ9C0C6 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CIPCQ9C0C6 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CIPCQ9C0C6 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CIPCQ9C0C6 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CIPCQ9C0C6 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CIPCQ9C0C6 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CIPCQ9C0C6 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CIPCQ9C0C6 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CIPCQ9C0C6 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CIPCQ9C0C6 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CIPCQ9C0C6 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CIPCQ9C0C6 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CIPCQ9C0C6 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CIPCQ9C0C6 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CIPCQ9C0C6 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CIPCQ9C0C6 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CIPCQ9C0C6 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CIPCQ9C0C6 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CIPCQ9C0C6 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CIPCQ9C0C6 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CIPCQ9C0C6 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CIPCQ9C0C6 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CIPCQ9C0C6 CD8B-201ENST00000331469 832 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CIPCQ9C0C6 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CIPCQ9C0C6 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CIPCQ9C0C6 ZC3H12D-202ENST00000409948 753 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CIPCQ9C0C6 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CIPCQ9C0C6 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CIPCQ9C0C6 AC016735.2-201ENST00000438736 569 ntTSL 4 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CIPCQ9C0C6 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CIPCQ9C0C6 FAM207CP-201ENST00000443486 507 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
CIPCQ9C0C6 CCDC159-201ENST00000458408 1062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CIPCQ9C0C6 RAD51D-205ENST00000460118 1064 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CIPCQ9C0C6 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CIPCQ9C0C6 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CIPCQ9C0C6 MPI-209ENST00000564003 1195 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CIPCQ9C0C6 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CIPCQ9C0C6 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CIPCQ9C0C6 YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 718 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
CIPCQ9C0C6 AC008761.3-201ENST00000624803 892 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
CIPCQ9C0C6 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CIPCQ9C0C6 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CIPCQ9C0C6 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
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