Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0B6

BRINP2, BMP/retinoic acid-inducible neural-specific protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 783 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRINP2Q9C0B6 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
BRINP2Q9C0B6 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
BRINP2Q9C0B6 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
BRINP2Q9C0B6 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
BRINP2Q9C0B6 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
BRINP2Q9C0B6 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
BRINP2Q9C0B6 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
BRINP2Q9C0B6 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
BRINP2Q9C0B6 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
BRINP2Q9C0B6 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
BRINP2Q9C0B6 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
BRINP2Q9C0B6 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
BRINP2Q9C0B6 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
BRINP2Q9C0B6 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
BRINP2Q9C0B6 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
BRINP2Q9C0B6 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
BRINP2Q9C0B6 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
BRINP2Q9C0B6 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
BRINP2Q9C0B6 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
BRINP2Q9C0B6 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
BRINP2Q9C0B6 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
BRINP2Q9C0B6 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
BRINP2Q9C0B6 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
BRINP2Q9C0B6 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
BRINP2Q9C0B6 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
BRINP2Q9C0B6 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
BRINP2Q9C0B6 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
BRINP2Q9C0B6 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
BRINP2Q9C0B6 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
BRINP2Q9C0B6 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
BRINP2Q9C0B6 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
BRINP2Q9C0B6 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
BRINP2Q9C0B6 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
BRINP2Q9C0B6 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
BRINP2Q9C0B6 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
BRINP2Q9C0B6 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
BRINP2Q9C0B6 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
BRINP2Q9C0B6 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
BRINP2Q9C0B6 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
BRINP2Q9C0B6 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
BRINP2Q9C0B6 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
BRINP2Q9C0B6 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
BRINP2Q9C0B6 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
BRINP2Q9C0B6 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
BRINP2Q9C0B6 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
BRINP2Q9C0B6 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
BRINP2Q9C0B6 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
BRINP2Q9C0B6 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
BRINP2Q9C0B6 NR6A1-205ENST00000487099 7031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
BRINP2Q9C0B6 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
BRINP2Q9C0B6 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
BRINP2Q9C0B6 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
BRINP2Q9C0B6 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
BRINP2Q9C0B6 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
BRINP2Q9C0B6 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
BRINP2Q9C0B6 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
BRINP2Q9C0B6 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
BRINP2Q9C0B6 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
BRINP2Q9C0B6 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
BRINP2Q9C0B6 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
BRINP2Q9C0B6 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
BRINP2Q9C0B6 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
BRINP2Q9C0B6 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
BRINP2Q9C0B6 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
BRINP2Q9C0B6 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
BRINP2Q9C0B6 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
BRINP2Q9C0B6 SLC12A5-209ENST00000616201 2955 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
BRINP2Q9C0B6 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
BRINP2Q9C0B6 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
BRINP2Q9C0B6 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
BRINP2Q9C0B6 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
BRINP2Q9C0B6 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
BRINP2Q9C0B6 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
BRINP2Q9C0B6 EVPL-201ENST00000301607 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
BRINP2Q9C0B6 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
BRINP2Q9C0B6 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
BRINP2Q9C0B6 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
BRINP2Q9C0B6 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
BRINP2Q9C0B6 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
BRINP2Q9C0B6 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
BRINP2Q9C0B6 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
BRINP2Q9C0B6 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
BRINP2Q9C0B6 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
BRINP2Q9C0B6 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
BRINP2Q9C0B6 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
BRINP2Q9C0B6 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
BRINP2Q9C0B6 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
BRINP2Q9C0B6 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
BRINP2Q9C0B6 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
BRINP2Q9C0B6 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
BRINP2Q9C0B6 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
BRINP2Q9C0B6 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
BRINP2Q9C0B6 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
BRINP2Q9C0B6 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
BRINP2Q9C0B6 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
BRINP2Q9C0B6 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
BRINP2Q9C0B6 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
BRINP2Q9C0B6 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
BRINP2Q9C0B6 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
BRINP2Q9C0B6 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms