Protein–RNA interactions for Protein: Q9C037

TRIM4, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM4, humanhuman

Predictions only

Length 500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM4Q9C037 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRIM4Q9C037 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRIM4Q9C037 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRIM4Q9C037 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
TRIM4Q9C037 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRIM4Q9C037 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRIM4Q9C037 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRIM4Q9C037 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
TRIM4Q9C037 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRIM4Q9C037 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
TRIM4Q9C037 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRIM4Q9C037 GOPC-203ENST00000535237 4460 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRIM4Q9C037 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRIM4Q9C037 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRIM4Q9C037 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRIM4Q9C037 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRIM4Q9C037 MICAL1-201ENST00000358577 3142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRIM4Q9C037 EPHX2-207ENST00000521400 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRIM4Q9C037 KCNC2-208ENST00000549446 5625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRIM4Q9C037 PXN-207ENST00000536957 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRIM4Q9C037 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRIM4Q9C037 DIXDC1-201ENST00000440460 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRIM4Q9C037 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRIM4Q9C037 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRIM4Q9C037 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRIM4Q9C037 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRIM4Q9C037 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRIM4Q9C037 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRIM4Q9C037 ANKMY1-207ENST00000403283 2874 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRIM4Q9C037 DTNB-228ENST00000496972 2328 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRIM4Q9C037 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRIM4Q9C037 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRIM4Q9C037 VWA2-202ENST00000392982 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRIM4Q9C037 PATZ1-202ENST00000266269 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRIM4Q9C037 XRRA1-202ENST00000340360 5681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRIM4Q9C037 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRIM4Q9C037 DPYSL3-201ENST00000343218 5476 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRIM4Q9C037 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRIM4Q9C037 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRIM4Q9C037 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRIM4Q9C037 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRIM4Q9C037 BCAR1-207ENST00000538440 3192 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRIM4Q9C037 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRIM4Q9C037 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRIM4Q9C037 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRIM4Q9C037 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRIM4Q9C037 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRIM4Q9C037 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRIM4Q9C037 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRIM4Q9C037 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRIM4Q9C037 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRIM4Q9C037 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRIM4Q9C037 IFT20-209ENST00000579419 787 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRIM4Q9C037 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
TRIM4Q9C037 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRIM4Q9C037 NEBL-203ENST00000417816 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRIM4Q9C037 GPD1L-201ENST00000282541 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRIM4Q9C037 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRIM4Q9C037 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRIM4Q9C037 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRIM4Q9C037 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRIM4Q9C037 SSH3-203ENST00000376757 2990 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRIM4Q9C037 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRIM4Q9C037 FASTKD5-201ENST00000380266 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRIM4Q9C037 ITGB2-206ENST00000397852 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRIM4Q9C037 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRIM4Q9C037 GPN1-212ENST00000616939 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRIM4Q9C037 PRPS1-204ENST00000372435 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRIM4Q9C037 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRIM4Q9C037 RTEL1-201ENST00000318100 4676 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRIM4Q9C037 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRIM4Q9C037 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRIM4Q9C037 GLUL-202ENST00000331872 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRIM4Q9C037 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRIM4Q9C037 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRIM4Q9C037 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRIM4Q9C037 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRIM4Q9C037 SLC4A7-210ENST00000440156 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRIM4Q9C037 FAM219A-204ENST00000379081 3543 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRIM4Q9C037 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRIM4Q9C037 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRIM4Q9C037 KCNG3-202ENST00000394973 3656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRIM4Q9C037 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRIM4Q9C037 POU2F2-207ENST00000529067 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRIM4Q9C037 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRIM4Q9C037 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRIM4Q9C037 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRIM4Q9C037 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRIM4Q9C037 ARRB2-203ENST00000381488 1236 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRIM4Q9C037 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRIM4Q9C037 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRIM4Q9C037 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRIM4Q9C037 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRIM4Q9C037 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRIM4Q9C037 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRIM4Q9C037 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRIM4Q9C037 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRIM4Q9C037 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRIM4Q9C037 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRIM4Q9C037 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.8 ms