Protein–RNA interactions for Protein: Q99743

NPAS2, Neuronal PAS domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 824 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPAS2Q99743 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NPAS2Q99743 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NPAS2Q99743 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NPAS2Q99743 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NPAS2Q99743 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NPAS2Q99743 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NPAS2Q99743 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NPAS2Q99743 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NPAS2Q99743 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NPAS2Q99743 MOXD1-202ENST00000367963 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NPAS2Q99743 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NPAS2Q99743 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NPAS2Q99743 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
NPAS2Q99743 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
NPAS2Q99743 LDLR-204ENST00000545707 2429 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NPAS2Q99743 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NPAS2Q99743 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NPAS2Q99743 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NPAS2Q99743 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NPAS2Q99743 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NPAS2Q99743 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NPAS2Q99743 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
NPAS2Q99743 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NPAS2Q99743 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NPAS2Q99743 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NPAS2Q99743 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
NPAS2Q99743 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NPAS2Q99743 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NPAS2Q99743 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NPAS2Q99743 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NPAS2Q99743 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
NPAS2Q99743 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NPAS2Q99743 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
NPAS2Q99743 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NPAS2Q99743 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NPAS2Q99743 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NPAS2Q99743 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
NPAS2Q99743 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NPAS2Q99743 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NPAS2Q99743 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NPAS2Q99743 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NPAS2Q99743 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NPAS2Q99743 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NPAS2Q99743 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NPAS2Q99743 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NPAS2Q99743 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NPAS2Q99743 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NPAS2Q99743 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NPAS2Q99743 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NPAS2Q99743 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NPAS2Q99743 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NPAS2Q99743 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NPAS2Q99743 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
NPAS2Q99743 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NPAS2Q99743 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NPAS2Q99743 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
NPAS2Q99743 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NPAS2Q99743 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NPAS2Q99743 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NPAS2Q99743 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NPAS2Q99743 SYT5-207ENST00000590851 3619 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NPAS2Q99743 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NPAS2Q99743 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NPAS2Q99743 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NPAS2Q99743 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NPAS2Q99743 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NPAS2Q99743 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NPAS2Q99743 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NPAS2Q99743 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NPAS2Q99743 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NPAS2Q99743 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NPAS2Q99743 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NPAS2Q99743 ZNF746-201ENST00000340622 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NPAS2Q99743 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
NPAS2Q99743 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NPAS2Q99743 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NPAS2Q99743 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NPAS2Q99743 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NPAS2Q99743 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NPAS2Q99743 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NPAS2Q99743 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NPAS2Q99743 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NPAS2Q99743 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NPAS2Q99743 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NPAS2Q99743 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NPAS2Q99743 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NPAS2Q99743 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NPAS2Q99743 BMP7-201ENST00000395863 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NPAS2Q99743 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NPAS2Q99743 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NPAS2Q99743 MAPKAPK3-203ENST00000446044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NPAS2Q99743 ZNF19-208ENST00000565637 2612 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NPAS2Q99743 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NPAS2Q99743 ZNF367-201ENST00000375256 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NPAS2Q99743 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NPAS2Q99743 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NPAS2Q99743 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NPAS2Q99743 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NPAS2Q99743 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NPAS2Q99743 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms