Protein–RNA interactions for Protein: Q96NE9

FRMD6, FERM domain-containing protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 622 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FRMD6Q96NE9 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
FRMD6Q96NE9 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FRMD6Q96NE9 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FRMD6Q96NE9 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FRMD6Q96NE9 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FRMD6Q96NE9 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FRMD6Q96NE9 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FRMD6Q96NE9 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FRMD6Q96NE9 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FRMD6Q96NE9 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FRMD6Q96NE9 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FRMD6Q96NE9 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
FRMD6Q96NE9 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
FRMD6Q96NE9 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FRMD6Q96NE9 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FRMD6Q96NE9 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FRMD6Q96NE9 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FRMD6Q96NE9 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FRMD6Q96NE9 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
FRMD6Q96NE9 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FRMD6Q96NE9 KHDRBS1-202ENST00000327300 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FRMD6Q96NE9 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FRMD6Q96NE9 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FRMD6Q96NE9 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FRMD6Q96NE9 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FRMD6Q96NE9 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FRMD6Q96NE9 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FRMD6Q96NE9 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
FRMD6Q96NE9 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FRMD6Q96NE9 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FRMD6Q96NE9 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FRMD6Q96NE9 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FRMD6Q96NE9 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FRMD6Q96NE9 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FRMD6Q96NE9 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FRMD6Q96NE9 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FRMD6Q96NE9 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FRMD6Q96NE9 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
FRMD6Q96NE9 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
FRMD6Q96NE9 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
FRMD6Q96NE9 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
FRMD6Q96NE9 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
FRMD6Q96NE9 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
FRMD6Q96NE9 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
FRMD6Q96NE9 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
FRMD6Q96NE9 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
FRMD6Q96NE9 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
FRMD6Q96NE9 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
FRMD6Q96NE9 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
FRMD6Q96NE9 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
FRMD6Q96NE9 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
FRMD6Q96NE9 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
FRMD6Q96NE9 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
FRMD6Q96NE9 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
FRMD6Q96NE9 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
FRMD6Q96NE9 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
FRMD6Q96NE9 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
FRMD6Q96NE9 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
FRMD6Q96NE9 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
FRMD6Q96NE9 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
FRMD6Q96NE9 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
FRMD6Q96NE9 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
FRMD6Q96NE9 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
FRMD6Q96NE9 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
FRMD6Q96NE9 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
FRMD6Q96NE9 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
FRMD6Q96NE9 NID1-201ENST00000264187 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
FRMD6Q96NE9 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
FRMD6Q96NE9 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
FRMD6Q96NE9 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
FRMD6Q96NE9 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
FRMD6Q96NE9 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
FRMD6Q96NE9 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
FRMD6Q96NE9 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
FRMD6Q96NE9 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
FRMD6Q96NE9 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
FRMD6Q96NE9 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
FRMD6Q96NE9 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
FRMD6Q96NE9 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
FRMD6Q96NE9 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
FRMD6Q96NE9 KDM5C-205ENST00000404049 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
FRMD6Q96NE9 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
FRMD6Q96NE9 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
FRMD6Q96NE9 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
FRMD6Q96NE9 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
FRMD6Q96NE9 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
FRMD6Q96NE9 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
FRMD6Q96NE9 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
FRMD6Q96NE9 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
FRMD6Q96NE9 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
FRMD6Q96NE9 SATB2-205ENST00000443023 6194 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
FRMD6Q96NE9 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
FRMD6Q96NE9 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
FRMD6Q96NE9 BNIP2-201ENST00000267859 6325 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
FRMD6Q96NE9 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
FRMD6Q96NE9 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
FRMD6Q96NE9 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
FRMD6Q96NE9 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
FRMD6Q96NE9 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
FRMD6Q96NE9 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.1 ms