Protein–RNA interactions for Protein: Q93096

PTP4A1, Protein tyrosine phosphatase type IVA 1, humanhuman

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Length 173 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTP4A1Q93096 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
PTP4A1Q93096 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
PTP4A1Q93096 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
PTP4A1Q93096 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
PTP4A1Q93096 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
PTP4A1Q93096 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PTP4A1Q93096 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PTP4A1Q93096 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PTP4A1Q93096 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PTP4A1Q93096 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PTP4A1Q93096 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PTP4A1Q93096 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PTP4A1Q93096 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PTP4A1Q93096 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PTP4A1Q93096 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PTP4A1Q93096 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PTP4A1Q93096 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PTP4A1Q93096 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PTP4A1Q93096 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PTP4A1Q93096 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PTP4A1Q93096 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PTP4A1Q93096 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PTP4A1Q93096 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PTP4A1Q93096 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PTP4A1Q93096 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
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PTP4A1Q93096 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
PTP4A1Q93096 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
PTP4A1Q93096 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PTP4A1Q93096 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PTP4A1Q93096 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PTP4A1Q93096 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PTP4A1Q93096 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PTP4A1Q93096 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PTP4A1Q93096 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PTP4A1Q93096 SYBU-207ENST00000433638 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PTP4A1Q93096 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PTP4A1Q93096 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PTP4A1Q93096 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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PTP4A1Q93096 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PTP4A1Q93096 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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PTP4A1Q93096 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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PTP4A1Q93096 SLC25A27-201ENST00000371347 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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PTP4A1Q93096 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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PTP4A1Q93096 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PTP4A1Q93096 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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PTP4A1Q93096 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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PTP4A1Q93096 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PTP4A1Q93096 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PTP4A1Q93096 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PTP4A1Q93096 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PTP4A1Q93096 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PTP4A1Q93096 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PTP4A1Q93096 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PTP4A1Q93096 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PTP4A1Q93096 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PTP4A1Q93096 SLC39A6-202ENST00000440549 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PTP4A1Q93096 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PTP4A1Q93096 ARHGAP45-212ENST00000590577 3218 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
PTP4A1Q93096 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PTP4A1Q93096 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PTP4A1Q93096 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
PTP4A1Q93096 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PTP4A1Q93096 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
PTP4A1Q93096 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PTP4A1Q93096 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PTP4A1Q93096 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
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PTP4A1Q93096 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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