Protein–RNA interactions for Protein: Q92544

TM9SF4, Transmembrane 9 superfamily member 4, humanhuman

Predictions only

Length 642 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM9SF4Q92544 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TM9SF4Q92544 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TM9SF4Q92544 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
TM9SF4Q92544 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TM9SF4Q92544 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
TM9SF4Q92544 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
TM9SF4Q92544 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
TM9SF4Q92544 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
TM9SF4Q92544 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
TM9SF4Q92544 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
TM9SF4Q92544 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TM9SF4Q92544 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TM9SF4Q92544 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TM9SF4Q92544 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TM9SF4Q92544 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TM9SF4Q92544 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TM9SF4Q92544 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TM9SF4Q92544 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
TM9SF4Q92544 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TM9SF4Q92544 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TM9SF4Q92544 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TM9SF4Q92544 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TM9SF4Q92544 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TM9SF4Q92544 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
TM9SF4Q92544 AL022316.1-201ENST00000428765 572 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TM9SF4Q92544 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TM9SF4Q92544 AL512638.1-201ENST00000457493 794 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
TM9SF4Q92544 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TM9SF4Q92544 S100A6-205ENST00000496817 673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TM9SF4Q92544 TERF1P3-201ENST00000505638 1227 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
TM9SF4Q92544 C5orf66-202ENST00000507641 547 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TM9SF4Q92544 CFL1-212ENST00000531413 636 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TM9SF4Q92544 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
TM9SF4Q92544 AC004846.2-201ENST00000556578 777 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TM9SF4Q92544 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
TM9SF4Q92544 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TM9SF4Q92544 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TM9SF4Q92544 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TM9SF4Q92544 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TM9SF4Q92544 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TM9SF4Q92544 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TM9SF4Q92544 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TM9SF4Q92544 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TM9SF4Q92544 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TM9SF4Q92544 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TM9SF4Q92544 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TM9SF4Q92544 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TM9SF4Q92544 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TM9SF4Q92544 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TM9SF4Q92544 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TM9SF4Q92544 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TM9SF4Q92544 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TM9SF4Q92544 ZDHHC11B-204ENST00000622126 1301 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TM9SF4Q92544 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TM9SF4Q92544 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TM9SF4Q92544 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TM9SF4Q92544 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TM9SF4Q92544 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
TM9SF4Q92544 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TM9SF4Q92544 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TM9SF4Q92544 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TM9SF4Q92544 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
TM9SF4Q92544 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TM9SF4Q92544 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TM9SF4Q92544 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TM9SF4Q92544 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TM9SF4Q92544 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TM9SF4Q92544 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TM9SF4Q92544 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TM9SF4Q92544 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TM9SF4Q92544 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TM9SF4Q92544 AC104135.1-201ENST00000418001 763 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TM9SF4Q92544 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TM9SF4Q92544 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TM9SF4Q92544 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TM9SF4Q92544 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
TM9SF4Q92544 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TM9SF4Q92544 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TM9SF4Q92544 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TM9SF4Q92544 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TM9SF4Q92544 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TM9SF4Q92544 RCAN3-211ENST00000630217 658 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TM9SF4Q92544 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
TM9SF4Q92544 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
TM9SF4Q92544 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TM9SF4Q92544 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TM9SF4Q92544 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TM9SF4Q92544 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TM9SF4Q92544 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TM9SF4Q92544 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TM9SF4Q92544 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TM9SF4Q92544 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TM9SF4Q92544 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
TM9SF4Q92544 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TM9SF4Q92544 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TM9SF4Q92544 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TM9SF4Q92544 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TM9SF4Q92544 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TM9SF4Q92544 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TM9SF4Q92544 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.5 ms