Protein–RNA interactions for Protein: Q8WUD4

CCDC12, Coiled-coil domain-containing protein 12, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 166 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC12Q8WUD4 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CCDC12Q8WUD4 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CCDC12Q8WUD4 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CCDC12Q8WUD4 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CCDC12Q8WUD4 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CCDC12Q8WUD4 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CCDC12Q8WUD4 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CCDC12Q8WUD4 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CCDC12Q8WUD4 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CCDC12Q8WUD4 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CCDC12Q8WUD4 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CCDC12Q8WUD4 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CCDC12Q8WUD4 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CCDC12Q8WUD4 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CCDC12Q8WUD4 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CCDC12Q8WUD4 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
CCDC12Q8WUD4 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
CCDC12Q8WUD4 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
CCDC12Q8WUD4 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CCDC12Q8WUD4 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CCDC12Q8WUD4 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CCDC12Q8WUD4 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CCDC12Q8WUD4 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CCDC12Q8WUD4 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
CCDC12Q8WUD4 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CCDC12Q8WUD4 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CCDC12Q8WUD4 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
CCDC12Q8WUD4 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CCDC12Q8WUD4 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CCDC12Q8WUD4 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CCDC12Q8WUD4 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CCDC12Q8WUD4 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CCDC12Q8WUD4 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CCDC12Q8WUD4 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CCDC12Q8WUD4 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CCDC12Q8WUD4 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CCDC12Q8WUD4 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CCDC12Q8WUD4 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CCDC12Q8WUD4 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CCDC12Q8WUD4 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CCDC12Q8WUD4 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CCDC12Q8WUD4 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CCDC12Q8WUD4 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CCDC12Q8WUD4 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CCDC12Q8WUD4 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CCDC12Q8WUD4 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CCDC12Q8WUD4 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CCDC12Q8WUD4 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CCDC12Q8WUD4 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CCDC12Q8WUD4 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CCDC12Q8WUD4 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CCDC12Q8WUD4 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CCDC12Q8WUD4 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CCDC12Q8WUD4 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CCDC12Q8WUD4 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CCDC12Q8WUD4 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
CCDC12Q8WUD4 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CCDC12Q8WUD4 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CCDC12Q8WUD4 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CCDC12Q8WUD4 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
CCDC12Q8WUD4 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CCDC12Q8WUD4 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CCDC12Q8WUD4 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CCDC12Q8WUD4 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CCDC12Q8WUD4 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CCDC12Q8WUD4 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CCDC12Q8WUD4 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CCDC12Q8WUD4 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CCDC12Q8WUD4 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
CCDC12Q8WUD4 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CCDC12Q8WUD4 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
CCDC12Q8WUD4 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CCDC12Q8WUD4 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CCDC12Q8WUD4 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CCDC12Q8WUD4 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CCDC12Q8WUD4 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CCDC12Q8WUD4 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CCDC12Q8WUD4 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CCDC12Q8WUD4 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CCDC12Q8WUD4 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CCDC12Q8WUD4 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CCDC12Q8WUD4 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CCDC12Q8WUD4 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CCDC12Q8WUD4 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CCDC12Q8WUD4 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CCDC12Q8WUD4 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CCDC12Q8WUD4 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
CCDC12Q8WUD4 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CCDC12Q8WUD4 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CCDC12Q8WUD4 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CCDC12Q8WUD4 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
CCDC12Q8WUD4 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
CCDC12Q8WUD4 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CCDC12Q8WUD4 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CCDC12Q8WUD4 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CCDC12Q8WUD4 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CCDC12Q8WUD4 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CCDC12Q8WUD4 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CCDC12Q8WUD4 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
CCDC12Q8WUD4 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.5 ms