Protein–RNA interactions for Protein: Q8NHV4

NEDD1, Protein NEDD1, humanhuman

Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD1Q8NHV4 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
NEDD1Q8NHV4 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
NEDD1Q8NHV4 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
NEDD1Q8NHV4 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
NEDD1Q8NHV4 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
NEDD1Q8NHV4 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
NEDD1Q8NHV4 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
NEDD1Q8NHV4 RBAKDN-201ENST00000498308 514 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
NEDD1Q8NHV4 AC008406.2-201ENST00000507058 532 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
NEDD1Q8NHV4 AC124067.4-202ENST00000522471 397 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
NEDD1Q8NHV4 AL161757.4-201ENST00000554149 621 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
NEDD1Q8NHV4 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
NEDD1Q8NHV4 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
NEDD1Q8NHV4 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
NEDD1Q8NHV4 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
NEDD1Q8NHV4 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
NEDD1Q8NHV4 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
NEDD1Q8NHV4 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
NEDD1Q8NHV4 FKBP6-202ENST00000413573 1507 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
NEDD1Q8NHV4 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
NEDD1Q8NHV4 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
NEDD1Q8NHV4 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
NEDD1Q8NHV4 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
NEDD1Q8NHV4 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
NEDD1Q8NHV4 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
NEDD1Q8NHV4 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
NEDD1Q8NHV4 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
NEDD1Q8NHV4 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
NEDD1Q8NHV4 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
NEDD1Q8NHV4 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
NEDD1Q8NHV4 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
NEDD1Q8NHV4 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
NEDD1Q8NHV4 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
NEDD1Q8NHV4 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
NEDD1Q8NHV4 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
NEDD1Q8NHV4 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
NEDD1Q8NHV4 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
NEDD1Q8NHV4 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
NEDD1Q8NHV4 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
NEDD1Q8NHV4 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
NEDD1Q8NHV4 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
NEDD1Q8NHV4 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
NEDD1Q8NHV4 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
NEDD1Q8NHV4 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
NEDD1Q8NHV4 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
NEDD1Q8NHV4 GOLGA6L11P-201ENST00000417252 1298 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
NEDD1Q8NHV4 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
NEDD1Q8NHV4 AC114501.2-201ENST00000439631 535 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
NEDD1Q8NHV4 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
NEDD1Q8NHV4 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
NEDD1Q8NHV4 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
NEDD1Q8NHV4 SDHAP3-202ENST00000515467 728 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
NEDD1Q8NHV4 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
NEDD1Q8NHV4 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
NEDD1Q8NHV4 MYMX-202ENST00000576476 682 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
NEDD1Q8NHV4 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC18.87■□□□□ 0.61
NEDD1Q8NHV4 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
NEDD1Q8NHV4 MRNIP-225ENST00000610475 810 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
NEDD1Q8NHV4 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
NEDD1Q8NHV4 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
NEDD1Q8NHV4 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
NEDD1Q8NHV4 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
NEDD1Q8NHV4 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
NEDD1Q8NHV4 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
NEDD1Q8NHV4 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
NEDD1Q8NHV4 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
NEDD1Q8NHV4 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
NEDD1Q8NHV4 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
NEDD1Q8NHV4 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
NEDD1Q8NHV4 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
NEDD1Q8NHV4 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
NEDD1Q8NHV4 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
NEDD1Q8NHV4 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
NEDD1Q8NHV4 PTGES3-202ENST00000414274 1547 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
NEDD1Q8NHV4 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
NEDD1Q8NHV4 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
NEDD1Q8NHV4 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
NEDD1Q8NHV4 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
NEDD1Q8NHV4 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
NEDD1Q8NHV4 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
NEDD1Q8NHV4 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
NEDD1Q8NHV4 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
NEDD1Q8NHV4 LINC01301-205ENST00000531654 1347 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
NEDD1Q8NHV4 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
NEDD1Q8NHV4 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
NEDD1Q8NHV4 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
NEDD1Q8NHV4 AC006001.2-201ENST00000448096 393 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
NEDD1Q8NHV4 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
NEDD1Q8NHV4 AL033519.3-201ENST00000450618 595 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
NEDD1Q8NHV4 COX20P2-201ENST00000452636 358 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
NEDD1Q8NHV4 RPL10P19-202ENST00000520582 722 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
NEDD1Q8NHV4 FAM92A-214ENST00000522324 1072 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
NEDD1Q8NHV4 RAB35-202ENST00000534951 939 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
NEDD1Q8NHV4 AC135586.1-201ENST00000539323 574 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
NEDD1Q8NHV4 AURKB-214ENST00000585124 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
NEDD1Q8NHV4 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC18.86■□□□□ 0.61
NEDD1Q8NHV4 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
NEDD1Q8NHV4 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
NEDD1Q8NHV4 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
NEDD1Q8NHV4 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms