Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6Q1

TMCO5A, Transmembrane and coiled-coil domain-containing protein 5A, humanhuman

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Length 288 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMCO5AQ8N6Q1 HIPK3-201ENST00000303296 7408 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TMCO5AQ8N6Q1 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TMCO5AQ8N6Q1 MARVELD1-201ENST00000285605 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TMCO5AQ8N6Q1 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TMCO5AQ8N6Q1 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TMCO5AQ8N6Q1 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TMCO5AQ8N6Q1 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TMCO5AQ8N6Q1 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TMCO5AQ8N6Q1 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
TMCO5AQ8N6Q1 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TMCO5AQ8N6Q1 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TMCO5AQ8N6Q1 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TMCO5AQ8N6Q1 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TMCO5AQ8N6Q1 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TMCO5AQ8N6Q1 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TMCO5AQ8N6Q1 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TMCO5AQ8N6Q1 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TMCO5AQ8N6Q1 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TMCO5AQ8N6Q1 FAM149B1-201ENST00000242505 5408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TMCO5AQ8N6Q1 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TMCO5AQ8N6Q1 MMRN2-201ENST00000372027 4375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TMCO5AQ8N6Q1 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TMCO5AQ8N6Q1 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TMCO5AQ8N6Q1 SLC25A37-206ENST00000519973 4823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TMCO5AQ8N6Q1 ANKRD23-201ENST00000318357 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TMCO5AQ8N6Q1 ZFAND4-203ENST00000374366 3821 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TMCO5AQ8N6Q1 DCBLD1-202ENST00000338728 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TMCO5AQ8N6Q1 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TMCO5AQ8N6Q1 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TMCO5AQ8N6Q1 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TMCO5AQ8N6Q1 SBF1P1-201ENST00000444527 5631 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
TMCO5AQ8N6Q1 SYTL3-205ENST00000611299 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TMCO5AQ8N6Q1 ANK1-202ENST00000289734 8297 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TMCO5AQ8N6Q1 AMZ1-201ENST00000312371 5516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TMCO5AQ8N6Q1 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TMCO5AQ8N6Q1 PDP1-201ENST00000297598 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TMCO5AQ8N6Q1 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TMCO5AQ8N6Q1 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TMCO5AQ8N6Q1 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TMCO5AQ8N6Q1 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TMCO5AQ8N6Q1 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TMCO5AQ8N6Q1 COL11A2-203ENST00000374708 6209 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TMCO5AQ8N6Q1 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TMCO5AQ8N6Q1 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TMCO5AQ8N6Q1 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
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TMCO5AQ8N6Q1 CDH24-202ENST00000397359 3552 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TMCO5AQ8N6Q1 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
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TMCO5AQ8N6Q1 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
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TMCO5AQ8N6Q1 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMCO5AQ8N6Q1 PRDM15-201ENST00000269844 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMCO5AQ8N6Q1 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMCO5AQ8N6Q1 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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TMCO5AQ8N6Q1 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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TMCO5AQ8N6Q1 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMCO5AQ8N6Q1 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMCO5AQ8N6Q1 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMCO5AQ8N6Q1 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMCO5AQ8N6Q1 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMCO5AQ8N6Q1 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
TMCO5AQ8N6Q1 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMCO5AQ8N6Q1 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMCO5AQ8N6Q1 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMCO5AQ8N6Q1 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMCO5AQ8N6Q1 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMCO5AQ8N6Q1 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMCO5AQ8N6Q1 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMCO5AQ8N6Q1 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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