Protein–RNA interactions for Protein: Q8N3C7

CLIP4, CAP-Gly domain-containing linker protein 4, humanhuman

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Length 705 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLIP4Q8N3C7 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CLIP4Q8N3C7 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CLIP4Q8N3C7 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CLIP4Q8N3C7 ANKHD1-202ENST00000297183 7606 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CLIP4Q8N3C7 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLIP4Q8N3C7 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLIP4Q8N3C7 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLIP4Q8N3C7 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLIP4Q8N3C7 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLIP4Q8N3C7 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLIP4Q8N3C7 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLIP4Q8N3C7 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLIP4Q8N3C7 PALLD-215ENST00000512127 2958 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLIP4Q8N3C7 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLIP4Q8N3C7 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLIP4Q8N3C7 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLIP4Q8N3C7 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLIP4Q8N3C7 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLIP4Q8N3C7 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLIP4Q8N3C7 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLIP4Q8N3C7 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CLIP4Q8N3C7 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CLIP4Q8N3C7 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLIP4Q8N3C7 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLIP4Q8N3C7 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CLIP4Q8N3C7 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLIP4Q8N3C7 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLIP4Q8N3C7 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLIP4Q8N3C7 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLIP4Q8N3C7 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLIP4Q8N3C7 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLIP4Q8N3C7 RUNX1-202ENST00000344691 7274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLIP4Q8N3C7 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLIP4Q8N3C7 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLIP4Q8N3C7 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLIP4Q8N3C7 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CLIP4Q8N3C7 LINC00917-207ENST00000601556 2618 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLIP4Q8N3C7 ABCB9-216ENST00000542678 6051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLIP4Q8N3C7 SLC6A11-201ENST00000254488 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLIP4Q8N3C7 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLIP4Q8N3C7 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLIP4Q8N3C7 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLIP4Q8N3C7 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLIP4Q8N3C7 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLIP4Q8N3C7 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLIP4Q8N3C7 EOMES-201ENST00000295743 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLIP4Q8N3C7 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLIP4Q8N3C7 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLIP4Q8N3C7 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLIP4Q8N3C7 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLIP4Q8N3C7 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLIP4Q8N3C7 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLIP4Q8N3C7 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLIP4Q8N3C7 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLIP4Q8N3C7 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLIP4Q8N3C7 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLIP4Q8N3C7 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
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CLIP4Q8N3C7 WIZ-206ENST00000599686 3644 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLIP4Q8N3C7 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLIP4Q8N3C7 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLIP4Q8N3C7 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLIP4Q8N3C7 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLIP4Q8N3C7 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLIP4Q8N3C7 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLIP4Q8N3C7 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
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CLIP4Q8N3C7 CNGB1-201ENST00000251102 5641 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLIP4Q8N3C7 SPEG-205ENST00000396698 3379 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLIP4Q8N3C7 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
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CLIP4Q8N3C7 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLIP4Q8N3C7 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLIP4Q8N3C7 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLIP4Q8N3C7 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLIP4Q8N3C7 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLIP4Q8N3C7 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLIP4Q8N3C7 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLIP4Q8N3C7 LEF1-202ENST00000379951 3477 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLIP4Q8N3C7 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLIP4Q8N3C7 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLIP4Q8N3C7 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLIP4Q8N3C7 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLIP4Q8N3C7 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLIP4Q8N3C7 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLIP4Q8N3C7 SOGA3-201ENST00000465909 3756 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLIP4Q8N3C7 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLIP4Q8N3C7 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLIP4Q8N3C7 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
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