Protein–RNA interactions for Protein: Q8IV32

CCDC71, Coiled-coil domain-containing protein 71, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC71Q8IV32 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC71Q8IV32 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC71Q8IV32 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC71Q8IV32 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC71Q8IV32 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC71Q8IV32 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC71Q8IV32 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC71Q8IV32 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC71Q8IV32 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC71Q8IV32 AC007728.2-201ENST00000563315 2296 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC71Q8IV32 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC71Q8IV32 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC71Q8IV32 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC71Q8IV32 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC71Q8IV32 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC71Q8IV32 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC71Q8IV32 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC71Q8IV32 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC71Q8IV32 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC71Q8IV32 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC71Q8IV32 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC71Q8IV32 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC71Q8IV32 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC71Q8IV32 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC71Q8IV32 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC71Q8IV32 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC71Q8IV32 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC71Q8IV32 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC71Q8IV32 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC71Q8IV32 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC71Q8IV32 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC71Q8IV32 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC71Q8IV32 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC71Q8IV32 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC71Q8IV32 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC71Q8IV32 MOXD1-202ENST00000367963 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC71Q8IV32 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC71Q8IV32 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC71Q8IV32 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC71Q8IV32 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC71Q8IV32 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC71Q8IV32 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC71Q8IV32 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC71Q8IV32 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC71Q8IV32 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC71Q8IV32 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC71Q8IV32 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC71Q8IV32 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC71Q8IV32 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC71Q8IV32 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC71Q8IV32 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC71Q8IV32 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC71Q8IV32 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC71Q8IV32 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC71Q8IV32 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC71Q8IV32 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC71Q8IV32 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC71Q8IV32 ZNF19-208ENST00000565637 2612 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC71Q8IV32 AL136379.1-201ENST00000623471 2642 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC71Q8IV32 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC71Q8IV32 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC71Q8IV32 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC71Q8IV32 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC71Q8IV32 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC71Q8IV32 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC71Q8IV32 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC71Q8IV32 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC71Q8IV32 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC71Q8IV32 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC71Q8IV32 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC71Q8IV32 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC71Q8IV32 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC71Q8IV32 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC71Q8IV32 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC71Q8IV32 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC71Q8IV32 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC71Q8IV32 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC71Q8IV32 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC71Q8IV32 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC71Q8IV32 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC71Q8IV32 RABGAP1L-201ENST00000251507 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC71Q8IV32 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC71Q8IV32 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC71Q8IV32 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC71Q8IV32 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC71Q8IV32 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC71Q8IV32 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC71Q8IV32 CXorf40A-209ENST00000441248 2411 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC71Q8IV32 LDLR-204ENST00000545707 2429 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC71Q8IV32 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC71Q8IV32 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC71Q8IV32 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC71Q8IV32 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC71Q8IV32 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC71Q8IV32 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC71Q8IV32 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC71Q8IV32 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC71Q8IV32 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC71Q8IV32 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC71Q8IV32 DAB2IP-201ENST00000259371 5469 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.1 ms