Protein–RNA interactions for Protein: Q76B58

BRINP3, BMP/retinoic acid-inducible neural-specific protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 766 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRINP3Q76B58 C12orf73-207ENST00000549478 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
BRINP3Q76B58 AL365199.1-201ENST00000421320 1714 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
BRINP3Q76B58 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
BRINP3Q76B58 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
BRINP3Q76B58 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
BRINP3Q76B58 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
BRINP3Q76B58 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
BRINP3Q76B58 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
BRINP3Q76B58 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
BRINP3Q76B58 SLC2A4-204ENST00000571308 1768 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
BRINP3Q76B58 AL034550.2-201ENST00000620523 1771 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
BRINP3Q76B58 AP4M1-201ENST00000359593 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
BRINP3Q76B58 AP4M1-206ENST00000429084 1836 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
BRINP3Q76B58 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
BRINP3Q76B58 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
BRINP3Q76B58 BEX5-201ENST00000333643 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
BRINP3Q76B58 CABP1-203ENST00000351200 770 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
BRINP3Q76B58 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
BRINP3Q76B58 GNG5-201ENST00000370641 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
BRINP3Q76B58 BEX2-201ENST00000372674 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
BRINP3Q76B58 ARL16-201ENST00000397498 1227 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
BRINP3Q76B58 CYB5R3-203ENST00000402438 1050 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
BRINP3Q76B58 MB-205ENST00000406324 582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
BRINP3Q76B58 RPL17P11-201ENST00000417593 544 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
BRINP3Q76B58 DEF8-202ENST00000418391 852 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
BRINP3Q76B58 NCBP2-203ENST00000422610 676 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
BRINP3Q76B58 C1orf210-201ENST00000423420 629 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
BRINP3Q76B58 AL136361.1-201ENST00000435429 506 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
BRINP3Q76B58 ZMYND10-AS1-201ENST00000440013 250 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
BRINP3Q76B58 AL590640.2-201ENST00000457038 527 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
BRINP3Q76B58 EIF3M-203ENST00000524896 1207 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
BRINP3Q76B58 CCDC144NL-AS1-209ENST00000577860 884 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
BRINP3Q76B58 AC105105.3-201ENST00000585470 646 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
BRINP3Q76B58 KLK3-207ENST00000595952 969 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
BRINP3Q76B58 AC008763.1-201ENST00000601797 843 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
BRINP3Q76B58 SIRT2-219ENST00000613542 1170 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
BRINP3Q76B58 Metazoa_SRP.69-201ENST00000615730 281 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
BRINP3Q76B58 ARL16-214ENST00000621051 1181 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
BRINP3Q76B58 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
BRINP3Q76B58 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
BRINP3Q76B58 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
BRINP3Q76B58 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
BRINP3Q76B58 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
BRINP3Q76B58 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
BRINP3Q76B58 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
BRINP3Q76B58 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
BRINP3Q76B58 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
BRINP3Q76B58 PRPF38B-202ENST00000370022 1591 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
BRINP3Q76B58 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
BRINP3Q76B58 DRD5P1-201ENST00000456605 1438 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
BRINP3Q76B58 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
BRINP3Q76B58 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
BRINP3Q76B58 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
BRINP3Q76B58 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
BRINP3Q76B58 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
BRINP3Q76B58 FAM3B-203ENST00000398647 864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
BRINP3Q76B58 FAM3B-204ENST00000398652 1125 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
BRINP3Q76B58 HLA-DQB2-229ENST00000411527 1059 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
BRINP3Q76B58 AL445430.1-201ENST00000419796 699 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
BRINP3Q76B58 PTPA-218ENST00000435132 618 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
BRINP3Q76B58 PGAP2-214ENST00000465307 1100 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
BRINP3Q76B58 FTLP10-202ENST00000505798 471 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
BRINP3Q76B58 SLC45A2-204ENST00000509381 1040 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
BRINP3Q76B58 SPATA21-206ENST00000612240 603 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
BRINP3Q76B58 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
BRINP3Q76B58 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
BRINP3Q76B58 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
BRINP3Q76B58 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
BRINP3Q76B58 TUBA3E-201ENST00000312988 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
BRINP3Q76B58 FBXO8-202ENST00000503293 1546 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
BRINP3Q76B58 AC007326.5-201ENST00000640084 1382 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
BRINP3Q76B58 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
BRINP3Q76B58 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
BRINP3Q76B58 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
BRINP3Q76B58 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
BRINP3Q76B58 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
BRINP3Q76B58 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
BRINP3Q76B58 COX4I1-201ENST00000253452 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
BRINP3Q76B58 CRYBA2-202ENST00000392096 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
BRINP3Q76B58 CYP46A4P-201ENST00000414953 267 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
BRINP3Q76B58 RN7SL720P-201ENST00000488178 304 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
BRINP3Q76B58 UCHL1-207ENST00000508768 827 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
BRINP3Q76B58 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
BRINP3Q76B58 ANAPC11-216ENST00000579133 563 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
BRINP3Q76B58 AC011474.2-201ENST00000579268 543 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
BRINP3Q76B58 GEMIN7-204ENST00000591747 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
BRINP3Q76B58 NKG7-204ENST00000595217 816 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
BRINP3Q76B58 SMCO4-206ENST00000596676 180 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
BRINP3Q76B58 AC145423.3-201ENST00000615987 467 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
BRINP3Q76B58 IDH3G-203ENST00000370093 1662 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
BRINP3Q76B58 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
BRINP3Q76B58 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
BRINP3Q76B58 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
BRINP3Q76B58 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
BRINP3Q76B58 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
BRINP3Q76B58 FXYD3-202ENST00000346446 1320 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
BRINP3Q76B58 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
BRINP3Q76B58 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
BRINP3Q76B58 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
BRINP3Q76B58 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.7 ms