Protein–RNA interactions for Protein: Q6UX27

VSTM1, V-set and transmembrane domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 236 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VSTM1Q6UX27 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
VSTM1Q6UX27 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
VSTM1Q6UX27 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
VSTM1Q6UX27 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
VSTM1Q6UX27 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
VSTM1Q6UX27 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
VSTM1Q6UX27 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
VSTM1Q6UX27 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
VSTM1Q6UX27 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
VSTM1Q6UX27 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
VSTM1Q6UX27 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
VSTM1Q6UX27 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
VSTM1Q6UX27 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
VSTM1Q6UX27 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
VSTM1Q6UX27 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
VSTM1Q6UX27 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
VSTM1Q6UX27 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
VSTM1Q6UX27 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
VSTM1Q6UX27 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
VSTM1Q6UX27 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
VSTM1Q6UX27 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
VSTM1Q6UX27 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
VSTM1Q6UX27 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC17.38■□□□□ 0.37
VSTM1Q6UX27 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
VSTM1Q6UX27 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
VSTM1Q6UX27 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
VSTM1Q6UX27 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
VSTM1Q6UX27 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
VSTM1Q6UX27 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
VSTM1Q6UX27 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
VSTM1Q6UX27 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
VSTM1Q6UX27 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
VSTM1Q6UX27 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
VSTM1Q6UX27 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
VSTM1Q6UX27 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
VSTM1Q6UX27 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
VSTM1Q6UX27 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
VSTM1Q6UX27 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
VSTM1Q6UX27 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
VSTM1Q6UX27 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
VSTM1Q6UX27 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
VSTM1Q6UX27 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
VSTM1Q6UX27 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
VSTM1Q6UX27 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
VSTM1Q6UX27 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
VSTM1Q6UX27 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
VSTM1Q6UX27 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
VSTM1Q6UX27 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
VSTM1Q6UX27 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
VSTM1Q6UX27 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
VSTM1Q6UX27 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
VSTM1Q6UX27 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
VSTM1Q6UX27 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
VSTM1Q6UX27 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
VSTM1Q6UX27 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
VSTM1Q6UX27 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
VSTM1Q6UX27 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
VSTM1Q6UX27 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
VSTM1Q6UX27 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
VSTM1Q6UX27 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
VSTM1Q6UX27 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
VSTM1Q6UX27 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
VSTM1Q6UX27 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
VSTM1Q6UX27 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
VSTM1Q6UX27 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
VSTM1Q6UX27 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
VSTM1Q6UX27 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
VSTM1Q6UX27 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
VSTM1Q6UX27 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
VSTM1Q6UX27 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
VSTM1Q6UX27 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
VSTM1Q6UX27 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
VSTM1Q6UX27 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
VSTM1Q6UX27 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
VSTM1Q6UX27 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
VSTM1Q6UX27 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
VSTM1Q6UX27 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
VSTM1Q6UX27 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
VSTM1Q6UX27 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
VSTM1Q6UX27 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
VSTM1Q6UX27 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
VSTM1Q6UX27 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
VSTM1Q6UX27 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
VSTM1Q6UX27 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
VSTM1Q6UX27 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
VSTM1Q6UX27 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
VSTM1Q6UX27 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
VSTM1Q6UX27 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
VSTM1Q6UX27 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
VSTM1Q6UX27 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
VSTM1Q6UX27 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
VSTM1Q6UX27 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
VSTM1Q6UX27 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
VSTM1Q6UX27 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
VSTM1Q6UX27 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
VSTM1Q6UX27 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
VSTM1Q6UX27 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
VSTM1Q6UX27 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
VSTM1Q6UX27 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
VSTM1Q6UX27 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.6 ms