Protein–RNA interactions for Protein: Q6NSJ5

LRRC8E, Volume-regulated anion channel subunit LRRC8E, humanhuman

Predictions only

Length 796 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC8EQ6NSJ5 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
LRRC8EQ6NSJ5 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LRRC8EQ6NSJ5 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
LRRC8EQ6NSJ5 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LRRC8EQ6NSJ5 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LRRC8EQ6NSJ5 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
LRRC8EQ6NSJ5 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LRRC8EQ6NSJ5 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
LRRC8EQ6NSJ5 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
LRRC8EQ6NSJ5 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LRRC8EQ6NSJ5 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LRRC8EQ6NSJ5 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
LRRC8EQ6NSJ5 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
LRRC8EQ6NSJ5 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LRRC8EQ6NSJ5 GSK3B-201ENST00000264235 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LRRC8EQ6NSJ5 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
LRRC8EQ6NSJ5 ROBO1-209ENST00000495273 5600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LRRC8EQ6NSJ5 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
LRRC8EQ6NSJ5 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
LRRC8EQ6NSJ5 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LRRC8EQ6NSJ5 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
LRRC8EQ6NSJ5 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LRRC8EQ6NSJ5 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LRRC8EQ6NSJ5 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
LRRC8EQ6NSJ5 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
LRRC8EQ6NSJ5 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
LRRC8EQ6NSJ5 PSMG3-AS1-201ENST00000437621 5701 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LRRC8EQ6NSJ5 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
LRRC8EQ6NSJ5 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LRRC8EQ6NSJ5 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LRRC8EQ6NSJ5 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
LRRC8EQ6NSJ5 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
LRRC8EQ6NSJ5 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
LRRC8EQ6NSJ5 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
LRRC8EQ6NSJ5 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
LRRC8EQ6NSJ5 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LRRC8EQ6NSJ5 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
LRRC8EQ6NSJ5 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
LRRC8EQ6NSJ5 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
LRRC8EQ6NSJ5 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
LRRC8EQ6NSJ5 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LRRC8EQ6NSJ5 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LRRC8EQ6NSJ5 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LRRC8EQ6NSJ5 ZNF84-202ENST00000392319 7020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LRRC8EQ6NSJ5 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LRRC8EQ6NSJ5 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LRRC8EQ6NSJ5 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
LRRC8EQ6NSJ5 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
LRRC8EQ6NSJ5 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
LRRC8EQ6NSJ5 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
LRRC8EQ6NSJ5 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LRRC8EQ6NSJ5 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
LRRC8EQ6NSJ5 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LRRC8EQ6NSJ5 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LRRC8EQ6NSJ5 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LRRC8EQ6NSJ5 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LRRC8EQ6NSJ5 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LRRC8EQ6NSJ5 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LRRC8EQ6NSJ5 ARHGAP39-201ENST00000276826 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LRRC8EQ6NSJ5 MBNL1-202ENST00000282488 6458 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LRRC8EQ6NSJ5 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LRRC8EQ6NSJ5 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LRRC8EQ6NSJ5 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
LRRC8EQ6NSJ5 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LRRC8EQ6NSJ5 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LRRC8EQ6NSJ5 PCDHA10-201ENST00000307360 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LRRC8EQ6NSJ5 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LRRC8EQ6NSJ5 PDE4C-207ENST00000594617 4655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LRRC8EQ6NSJ5 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LRRC8EQ6NSJ5 ARHGEF6-202ENST00000370620 4764 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LRRC8EQ6NSJ5 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LRRC8EQ6NSJ5 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LRRC8EQ6NSJ5 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LRRC8EQ6NSJ5 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
LRRC8EQ6NSJ5 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
LRRC8EQ6NSJ5 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LRRC8EQ6NSJ5 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LRRC8EQ6NSJ5 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LRRC8EQ6NSJ5 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LRRC8EQ6NSJ5 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LRRC8EQ6NSJ5 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LRRC8EQ6NSJ5 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LRRC8EQ6NSJ5 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LRRC8EQ6NSJ5 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LRRC8EQ6NSJ5 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LRRC8EQ6NSJ5 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LRRC8EQ6NSJ5 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LRRC8EQ6NSJ5 PTPRF-201ENST00000359947 7727 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LRRC8EQ6NSJ5 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LRRC8EQ6NSJ5 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LRRC8EQ6NSJ5 KCTD7-206ENST00000639828 5951 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LRRC8EQ6NSJ5 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LRRC8EQ6NSJ5 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LRRC8EQ6NSJ5 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LRRC8EQ6NSJ5 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LRRC8EQ6NSJ5 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LRRC8EQ6NSJ5 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LRRC8EQ6NSJ5 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
LRRC8EQ6NSJ5 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LRRC8EQ6NSJ5 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.3 ms