Protein–RNA interactions for Protein: Q6KB66

KRT80, Keratin, type II cytoskeletal 80, humanhuman

Predictions only

Length 452 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT80Q6KB66 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
KRT80Q6KB66 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
KRT80Q6KB66 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
KRT80Q6KB66 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
KRT80Q6KB66 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
KRT80Q6KB66 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
KRT80Q6KB66 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
KRT80Q6KB66 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
KRT80Q6KB66 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
KRT80Q6KB66 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
KRT80Q6KB66 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
KRT80Q6KB66 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
KRT80Q6KB66 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
KRT80Q6KB66 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
KRT80Q6KB66 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
KRT80Q6KB66 AC004922.1-201ENST00000638617 2430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
KRT80Q6KB66 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
KRT80Q6KB66 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
KRT80Q6KB66 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
KRT80Q6KB66 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
KRT80Q6KB66 OTOF-202ENST00000338581 4954 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
KRT80Q6KB66 ZNF655-212ENST00000424881 4666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
KRT80Q6KB66 SLC6A13-203ENST00000445055 1950 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
KRT80Q6KB66 PCDHA9-202ENST00000532602 6293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
KRT80Q6KB66 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
KRT80Q6KB66 SYN1-201ENST00000295987 3299 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
KRT80Q6KB66 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
KRT80Q6KB66 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
KRT80Q6KB66 SPRED1-201ENST00000299084 7780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
KRT80Q6KB66 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
KRT80Q6KB66 ABI3-201ENST00000225941 2109 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
KRT80Q6KB66 DEGS1-201ENST00000323699 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
KRT80Q6KB66 LCK-206ENST00000373564 2137 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
KRT80Q6KB66 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
KRT80Q6KB66 IMPDH1-202ENST00000348127 2479 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
KRT80Q6KB66 PRMT9-201ENST00000322396 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
KRT80Q6KB66 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
KRT80Q6KB66 TRMT2B-201ENST00000372935 2921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
KRT80Q6KB66 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
KRT80Q6KB66 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
KRT80Q6KB66 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
KRT80Q6KB66 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
KRT80Q6KB66 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
KRT80Q6KB66 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
KRT80Q6KB66 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
KRT80Q6KB66 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
KRT80Q6KB66 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
KRT80Q6KB66 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
KRT80Q6KB66 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
KRT80Q6KB66 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
KRT80Q6KB66 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
KRT80Q6KB66 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
KRT80Q6KB66 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
KRT80Q6KB66 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
KRT80Q6KB66 AUTS2-217ENST00000611706 4583 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
KRT80Q6KB66 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
KRT80Q6KB66 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
KRT80Q6KB66 SH2D3C-206ENST00000429553 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
KRT80Q6KB66 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
KRT80Q6KB66 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
KRT80Q6KB66 SNX19-201ENST00000265909 6535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
KRT80Q6KB66 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
KRT80Q6KB66 ZFPM2-206ENST00000520492 3960 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
KRT80Q6KB66 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
KRT80Q6KB66 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
KRT80Q6KB66 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
KRT80Q6KB66 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
KRT80Q6KB66 SLC4A3-202ENST00000317151 4069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
KRT80Q6KB66 NOP9-201ENST00000267425 6033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
KRT80Q6KB66 KMT2E-202ENST00000311117 6874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
KRT80Q6KB66 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
KRT80Q6KB66 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
KRT80Q6KB66 PKIA-202ENST00000396418 4163 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
KRT80Q6KB66 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
KRT80Q6KB66 MTA2-201ENST00000278823 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
KRT80Q6KB66 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
KRT80Q6KB66 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
KRT80Q6KB66 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
KRT80Q6KB66 TLE4-204ENST00000376537 2793 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
KRT80Q6KB66 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
KRT80Q6KB66 AP000866.1-201ENST00000499143 2886 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
KRT80Q6KB66 APBA2-205ENST00000558330 3349 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
KRT80Q6KB66 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
KRT80Q6KB66 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
KRT80Q6KB66 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
KRT80Q6KB66 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
KRT80Q6KB66 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
KRT80Q6KB66 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
KRT80Q6KB66 ACTN2-206ENST00000542672 4906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
KRT80Q6KB66 TCP10-202ENST00000397829 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
KRT80Q6KB66 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
KRT80Q6KB66 MIR137HG-202ENST00000424528 2639 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
KRT80Q6KB66 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
KRT80Q6KB66 EDN3-201ENST00000311585 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
KRT80Q6KB66 NFATC4-221ENST00000555453 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
KRT80Q6KB66 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
KRT80Q6KB66 CHRNA7-201ENST00000306901 6181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
KRT80Q6KB66 ANKRD50-202ENST00000515641 4212 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
KRT80Q6KB66 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
KRT80Q6KB66 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.3 ms