Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTL7

FNDC7, Fibronectin type III domain-containing protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 733 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FNDC7Q5VTL7 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
FNDC7Q5VTL7 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
FNDC7Q5VTL7 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
FNDC7Q5VTL7 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
FNDC7Q5VTL7 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
FNDC7Q5VTL7 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
FNDC7Q5VTL7 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
FNDC7Q5VTL7 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
FNDC7Q5VTL7 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC14.95□□□□□ -0.02
FNDC7Q5VTL7 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
FNDC7Q5VTL7 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
FNDC7Q5VTL7 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
FNDC7Q5VTL7 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
FNDC7Q5VTL7 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
FNDC7Q5VTL7 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
FNDC7Q5VTL7 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
FNDC7Q5VTL7 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
FNDC7Q5VTL7 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
FNDC7Q5VTL7 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
FNDC7Q5VTL7 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
FNDC7Q5VTL7 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
FNDC7Q5VTL7 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
FNDC7Q5VTL7 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
FNDC7Q5VTL7 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
FNDC7Q5VTL7 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
FNDC7Q5VTL7 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
FNDC7Q5VTL7 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
FNDC7Q5VTL7 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
FNDC7Q5VTL7 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
FNDC7Q5VTL7 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
FNDC7Q5VTL7 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
FNDC7Q5VTL7 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
FNDC7Q5VTL7 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
FNDC7Q5VTL7 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
FNDC7Q5VTL7 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
FNDC7Q5VTL7 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
FNDC7Q5VTL7 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC14.94□□□□□ -0.02
FNDC7Q5VTL7 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
FNDC7Q5VTL7 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
FNDC7Q5VTL7 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
FNDC7Q5VTL7 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
FNDC7Q5VTL7 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
FNDC7Q5VTL7 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
FNDC7Q5VTL7 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
FNDC7Q5VTL7 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
FNDC7Q5VTL7 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
FNDC7Q5VTL7 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
FNDC7Q5VTL7 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
FNDC7Q5VTL7 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
FNDC7Q5VTL7 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
FNDC7Q5VTL7 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
FNDC7Q5VTL7 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
FNDC7Q5VTL7 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
FNDC7Q5VTL7 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
FNDC7Q5VTL7 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
FNDC7Q5VTL7 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
FNDC7Q5VTL7 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
FNDC7Q5VTL7 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
FNDC7Q5VTL7 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
FNDC7Q5VTL7 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
FNDC7Q5VTL7 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
FNDC7Q5VTL7 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
FNDC7Q5VTL7 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
FNDC7Q5VTL7 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
FNDC7Q5VTL7 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
FNDC7Q5VTL7 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
FNDC7Q5VTL7 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
FNDC7Q5VTL7 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
FNDC7Q5VTL7 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
FNDC7Q5VTL7 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
FNDC7Q5VTL7 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
FNDC7Q5VTL7 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
FNDC7Q5VTL7 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
FNDC7Q5VTL7 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
FNDC7Q5VTL7 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
FNDC7Q5VTL7 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
FNDC7Q5VTL7 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
FNDC7Q5VTL7 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
FNDC7Q5VTL7 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
FNDC7Q5VTL7 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
FNDC7Q5VTL7 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC14.93□□□□□ -0.02
FNDC7Q5VTL7 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
FNDC7Q5VTL7 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
FNDC7Q5VTL7 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
FNDC7Q5VTL7 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
FNDC7Q5VTL7 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
FNDC7Q5VTL7 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
FNDC7Q5VTL7 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
FNDC7Q5VTL7 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
FNDC7Q5VTL7 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
FNDC7Q5VTL7 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
FNDC7Q5VTL7 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
FNDC7Q5VTL7 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
FNDC7Q5VTL7 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
FNDC7Q5VTL7 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
FNDC7Q5VTL7 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
FNDC7Q5VTL7 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
FNDC7Q5VTL7 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
FNDC7Q5VTL7 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
FNDC7Q5VTL7 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms