Protein–RNA interactions for Protein: Q5UIP0

RIF1, Telomere-associated protein RIF1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIF1Q5UIP0 TISP43-201ENST00000409793 538 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RIF1Q5UIP0 AC004973.1-201ENST00000413240 635 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RIF1Q5UIP0 AL139246.4-201ENST00000442305 514 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RIF1Q5UIP0 SUPT4H1P2-201ENST00000501248 353 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
RIF1Q5UIP0 AC021491.2-201ENST00000513017 607 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RIF1Q5UIP0 PGAM1P5-201ENST00000548011 764 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
RIF1Q5UIP0 AC068397.2-201ENST00000558742 341 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RIF1Q5UIP0 ANAPC11-216ENST00000579133 563 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RIF1Q5UIP0 NAT9-212ENST00000581136 1011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RIF1Q5UIP0 TBCB-211ENST00000589996 724 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RIF1Q5UIP0 STPG3-204ENST00000611378 1015 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RIF1Q5UIP0 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RIF1Q5UIP0 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RIF1Q5UIP0 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RIF1Q5UIP0 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RIF1Q5UIP0 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RIF1Q5UIP0 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RIF1Q5UIP0 KATNA1-201ENST00000335643 1564 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RIF1Q5UIP0 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RIF1Q5UIP0 CDK3-202ENST00000448471 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RIF1Q5UIP0 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RIF1Q5UIP0 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RIF1Q5UIP0 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RIF1Q5UIP0 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RIF1Q5UIP0 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RIF1Q5UIP0 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RIF1Q5UIP0 AL591684.1-201ENST00000434533 234 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RIF1Q5UIP0 CXorf40A-211ENST00000450602 1204 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RIF1Q5UIP0 AL136982.2-201ENST00000451760 234 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RIF1Q5UIP0 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RIF1Q5UIP0 LCN10-206ENST00000527229 615 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RIF1Q5UIP0 AC023310.1-201ENST00000554836 735 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
RIF1Q5UIP0 DMAC2-208ENST00000589970 979 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RIF1Q5UIP0 DMAC2-215ENST00000597457 492 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RIF1Q5UIP0 AF254983.2-201ENST00000612331 135 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
RIF1Q5UIP0 IFI27-206ENST00000612813 725 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RIF1Q5UIP0 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RIF1Q5UIP0 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RIF1Q5UIP0 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RIF1Q5UIP0 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RIF1Q5UIP0 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RIF1Q5UIP0 SHOX-202ENST00000381575 1351 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RIF1Q5UIP0 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RIF1Q5UIP0 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RIF1Q5UIP0 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RIF1Q5UIP0 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RIF1Q5UIP0 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RIF1Q5UIP0 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RIF1Q5UIP0 IL9-201ENST00000274520 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RIF1Q5UIP0 AL596276.2-201ENST00000447525 331 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
RIF1Q5UIP0 AC234782.1-201ENST00000451950 919 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
RIF1Q5UIP0 AL136088.1-202ENST00000525871 439 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RIF1Q5UIP0 ACR-203ENST00000529621 708 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RIF1Q5UIP0 AC136475.1-202ENST00000602429 1151 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RIF1Q5UIP0 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RIF1Q5UIP0 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RIF1Q5UIP0 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RIF1Q5UIP0 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RIF1Q5UIP0 CAPZB-201ENST00000264202 858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RIF1Q5UIP0 ACKR1-201ENST00000368121 1240 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
RIF1Q5UIP0 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RIF1Q5UIP0 C1QBPP1-201ENST00000400117 770 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
RIF1Q5UIP0 DGCR5-204ENST00000440005 1299 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RIF1Q5UIP0 AC068134.1-201ENST00000441266 481 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RIF1Q5UIP0 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RIF1Q5UIP0 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RIF1Q5UIP0 EFCAB10-201ENST00000460135 717 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RIF1Q5UIP0 MRAS-205ENST00000474559 856 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RIF1Q5UIP0 AC091179.2-201ENST00000495536 532 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RIF1Q5UIP0 AP001790.1-201ENST00000511947 570 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RIF1Q5UIP0 C14orf132-202ENST00000553782 536 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RIF1Q5UIP0 AC073352.2-201ENST00000609385 439 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
RIF1Q5UIP0 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RIF1Q5UIP0 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RIF1Q5UIP0 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RIF1Q5UIP0 CLDND1-215ENST00000507874 1380 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RIF1Q5UIP0 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RIF1Q5UIP0 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RIF1Q5UIP0 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RIF1Q5UIP0 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RIF1Q5UIP0 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RIF1Q5UIP0 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RIF1Q5UIP0 LINC00470-210ENST00000584090 1334 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RIF1Q5UIP0 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
RIF1Q5UIP0 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
RIF1Q5UIP0 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
RIF1Q5UIP0 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
RIF1Q5UIP0 AL445430.1-201ENST00000419796 699 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
RIF1Q5UIP0 TCERG1L-AS1-201ENST00000436942 472 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
RIF1Q5UIP0 HOMER2P2-201ENST00000451621 847 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
RIF1Q5UIP0 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
RIF1Q5UIP0 AC018680.1-202ENST00000500324 525 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.09
RIF1Q5UIP0 ANAPC15-214ENST00000543587 883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
RIF1Q5UIP0 RN7SL774P-201ENST00000577467 290 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
RIF1Q5UIP0 FAM210A-202ENST00000402563 4240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.09
RIF1Q5UIP0 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
RIF1Q5UIP0 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
RIF1Q5UIP0 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RIF1Q5UIP0 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RIF1Q5UIP0 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.9 ms