Protein–RNA interactions for Protein: Q5T2W1

PDZK1, Na(+)/H(+) exchange regulatory cofactor NHE-RF3, humanhuman

Predictions only

Length 519 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDZK1Q5T2W1 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PDZK1Q5T2W1 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PDZK1Q5T2W1 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PDZK1Q5T2W1 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PDZK1Q5T2W1 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PDZK1Q5T2W1 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
PDZK1Q5T2W1 MMRN2-201ENST00000372027 4375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PDZK1Q5T2W1 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PDZK1Q5T2W1 NEK7-202ENST00000367385 4149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PDZK1Q5T2W1 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PDZK1Q5T2W1 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PDZK1Q5T2W1 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PDZK1Q5T2W1 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
PDZK1Q5T2W1 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PDZK1Q5T2W1 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PDZK1Q5T2W1 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PDZK1Q5T2W1 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PDZK1Q5T2W1 CADPS2-205ENST00000449022 4073 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PDZK1Q5T2W1 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PDZK1Q5T2W1 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PDZK1Q5T2W1 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PDZK1Q5T2W1 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PDZK1Q5T2W1 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PDZK1Q5T2W1 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PDZK1Q5T2W1 ADAMTS14-202ENST00000373208 5269 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PDZK1Q5T2W1 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PDZK1Q5T2W1 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PDZK1Q5T2W1 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PDZK1Q5T2W1 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PDZK1Q5T2W1 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
PDZK1Q5T2W1 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PDZK1Q5T2W1 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PDZK1Q5T2W1 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PDZK1Q5T2W1 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PDZK1Q5T2W1 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PDZK1Q5T2W1 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
PDZK1Q5T2W1 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PDZK1Q5T2W1 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PDZK1Q5T2W1 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PDZK1Q5T2W1 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PDZK1Q5T2W1 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PDZK1Q5T2W1 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PDZK1Q5T2W1 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PDZK1Q5T2W1 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PDZK1Q5T2W1 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PDZK1Q5T2W1 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PDZK1Q5T2W1 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PDZK1Q5T2W1 ECE1-204ENST00000415912 5099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PDZK1Q5T2W1 EIF4G1-212ENST00000424196 5653 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PDZK1Q5T2W1 KIAA1211-201ENST00000264229 4109 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PDZK1Q5T2W1 MFN2-203ENST00000444836 4531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PDZK1Q5T2W1 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
PDZK1Q5T2W1 RCOR1-201ENST00000262241 5754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PDZK1Q5T2W1 NTRK2-202ENST00000304053 8226 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PDZK1Q5T2W1 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PDZK1Q5T2W1 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PDZK1Q5T2W1 RTN3-205ENST00000356000 2645 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PDZK1Q5T2W1 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PDZK1Q5T2W1 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PDZK1Q5T2W1 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
PDZK1Q5T2W1 CCAR2-201ENST00000308511 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PDZK1Q5T2W1 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PDZK1Q5T2W1 BNIP2-201ENST00000267859 6325 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PDZK1Q5T2W1 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PDZK1Q5T2W1 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PDZK1Q5T2W1 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PDZK1Q5T2W1 OSBPL10-201ENST00000396556 6600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PDZK1Q5T2W1 GOLGA7B-201ENST00000370602 6447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PDZK1Q5T2W1 ST14-201ENST00000278742 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PDZK1Q5T2W1 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PDZK1Q5T2W1 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PDZK1Q5T2W1 PTPRO-202ENST00000348962 5061 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PDZK1Q5T2W1 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PDZK1Q5T2W1 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PDZK1Q5T2W1 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PDZK1Q5T2W1 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PDZK1Q5T2W1 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
PDZK1Q5T2W1 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PDZK1Q5T2W1 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PDZK1Q5T2W1 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PDZK1Q5T2W1 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PDZK1Q5T2W1 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PDZK1Q5T2W1 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PDZK1Q5T2W1 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PDZK1Q5T2W1 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
PDZK1Q5T2W1 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PDZK1Q5T2W1 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PDZK1Q5T2W1 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PDZK1Q5T2W1 EML1-201ENST00000262233 4535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PDZK1Q5T2W1 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PDZK1Q5T2W1 CAMKK2-211ENST00000538733 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PDZK1Q5T2W1 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PDZK1Q5T2W1 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PDZK1Q5T2W1 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PDZK1Q5T2W1 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PDZK1Q5T2W1 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PDZK1Q5T2W1 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PDZK1Q5T2W1 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PDZK1Q5T2W1 FAM8A1-201ENST00000259963 4677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PDZK1Q5T2W1 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms