Protein–RNA interactions for Protein: Q5FBB7

SGO1, Shugoshin 1, humanhuman

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Length 561 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGO1Q5FBB7 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SGO1Q5FBB7 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
SGO1Q5FBB7 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
SGO1Q5FBB7 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SGO1Q5FBB7 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SGO1Q5FBB7 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SGO1Q5FBB7 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SGO1Q5FBB7 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SGO1Q5FBB7 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SGO1Q5FBB7 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SGO1Q5FBB7 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SGO1Q5FBB7 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SGO1Q5FBB7 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SGO1Q5FBB7 AC027601.1-201ENST00000575922 4506 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SGO1Q5FBB7 OSBP2-201ENST00000332585 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SGO1Q5FBB7 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SGO1Q5FBB7 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SGO1Q5FBB7 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SGO1Q5FBB7 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SGO1Q5FBB7 PAFAH1B1-202ENST00000397195 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SGO1Q5FBB7 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SGO1Q5FBB7 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
SGO1Q5FBB7 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SGO1Q5FBB7 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SGO1Q5FBB7 NF2-210ENST00000413209 4733 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SGO1Q5FBB7 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SGO1Q5FBB7 PIK3R1-211ENST00000521381 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SGO1Q5FBB7 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SGO1Q5FBB7 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SGO1Q5FBB7 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SGO1Q5FBB7 PER1-201ENST00000317276 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SGO1Q5FBB7 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SGO1Q5FBB7 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
SGO1Q5FBB7 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SGO1Q5FBB7 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SGO1Q5FBB7 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SGO1Q5FBB7 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SGO1Q5FBB7 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SGO1Q5FBB7 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SGO1Q5FBB7 KIF21A-202ENST00000361961 6601 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SGO1Q5FBB7 NBEA-208ENST00000629018 10791 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SGO1Q5FBB7 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SGO1Q5FBB7 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SGO1Q5FBB7 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
SGO1Q5FBB7 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SGO1Q5FBB7 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SGO1Q5FBB7 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SGO1Q5FBB7 DAB2IP-201ENST00000259371 5469 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SGO1Q5FBB7 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SGO1Q5FBB7 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SGO1Q5FBB7 SLC9A7-205ENST00000616978 10024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SGO1Q5FBB7 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SGO1Q5FBB7 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SGO1Q5FBB7 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SGO1Q5FBB7 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SGO1Q5FBB7 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SGO1Q5FBB7 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SGO1Q5FBB7 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
SGO1Q5FBB7 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
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SGO1Q5FBB7 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SGO1Q5FBB7 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SGO1Q5FBB7 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SGO1Q5FBB7 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
SGO1Q5FBB7 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SGO1Q5FBB7 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
SGO1Q5FBB7 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SGO1Q5FBB7 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SGO1Q5FBB7 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
SGO1Q5FBB7 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SGO1Q5FBB7 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
SGO1Q5FBB7 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SGO1Q5FBB7 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SGO1Q5FBB7 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
SGO1Q5FBB7 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SGO1Q5FBB7 FOSL2-201ENST00000264716 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SGO1Q5FBB7 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SGO1Q5FBB7 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SGO1Q5FBB7 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SGO1Q5FBB7 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SGO1Q5FBB7 DPYSL3-201ENST00000343218 5476 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SGO1Q5FBB7 PTGFRN-201ENST00000393203 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SGO1Q5FBB7 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SGO1Q5FBB7 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SGO1Q5FBB7 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SGO1Q5FBB7 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SGO1Q5FBB7 DNAJC21-202ENST00000382021 6208 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SGO1Q5FBB7 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SGO1Q5FBB7 EIF4G1-203ENST00000350481 4990 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SGO1Q5FBB7 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SGO1Q5FBB7 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SGO1Q5FBB7 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SGO1Q5FBB7 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
SGO1Q5FBB7 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SGO1Q5FBB7 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SGO1Q5FBB7 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SGO1Q5FBB7 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SGO1Q5FBB7 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SGO1Q5FBB7 COBL-203ENST00000395542 5339 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SGO1Q5FBB7 NID1-201ENST00000264187 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
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