Protein–RNA interactions for Protein: Q587J7

TDRD12, Putative ATP-dependent RNA helicase TDRD12, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,177 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TDRD12Q587J7 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TDRD12Q587J7 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TDRD12Q587J7 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TDRD12Q587J7 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TDRD12Q587J7 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
TDRD12Q587J7 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
TDRD12Q587J7 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TDRD12Q587J7 EIF4G1-203ENST00000350481 4990 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TDRD12Q587J7 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
TDRD12Q587J7 RASA1-201ENST00000274376 3752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TDRD12Q587J7 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TDRD12Q587J7 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TDRD12Q587J7 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TDRD12Q587J7 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TDRD12Q587J7 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TDRD12Q587J7 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TDRD12Q587J7 EPOP-201ENST00000621654 3719 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TDRD12Q587J7 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TDRD12Q587J7 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TDRD12Q587J7 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TDRD12Q587J7 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TDRD12Q587J7 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TDRD12Q587J7 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TDRD12Q587J7 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TDRD12Q587J7 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TDRD12Q587J7 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TDRD12Q587J7 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
TDRD12Q587J7 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TDRD12Q587J7 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TDRD12Q587J7 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TDRD12Q587J7 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TDRD12Q587J7 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TDRD12Q587J7 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TDRD12Q587J7 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TDRD12Q587J7 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TDRD12Q587J7 DPYSL3-201ENST00000343218 5476 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TDRD12Q587J7 ERO1B-202ENST00000354619 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TDRD12Q587J7 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TDRD12Q587J7 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TDRD12Q587J7 RCOR1-201ENST00000262241 5754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TDRD12Q587J7 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TDRD12Q587J7 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TDRD12Q587J7 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TDRD12Q587J7 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TDRD12Q587J7 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
TDRD12Q587J7 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TDRD12Q587J7 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TDRD12Q587J7 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TDRD12Q587J7 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TDRD12Q587J7 SHROOM4-201ENST00000289292 6261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TDRD12Q587J7 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TDRD12Q587J7 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TDRD12Q587J7 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TDRD12Q587J7 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TDRD12Q587J7 NFATC1-207ENST00000545796 3558 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TDRD12Q587J7 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TDRD12Q587J7 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TDRD12Q587J7 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TDRD12Q587J7 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TDRD12Q587J7 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TDRD12Q587J7 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TDRD12Q587J7 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TDRD12Q587J7 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TDRD12Q587J7 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TDRD12Q587J7 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TDRD12Q587J7 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
TDRD12Q587J7 ITSN1-205ENST00000381291 5437 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TDRD12Q587J7 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
TDRD12Q587J7 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TDRD12Q587J7 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TDRD12Q587J7 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TDRD12Q587J7 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TDRD12Q587J7 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TDRD12Q587J7 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
TDRD12Q587J7 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TDRD12Q587J7 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TDRD12Q587J7 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TDRD12Q587J7 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TDRD12Q587J7 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TDRD12Q587J7 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TDRD12Q587J7 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TDRD12Q587J7 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TDRD12Q587J7 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TDRD12Q587J7 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TDRD12Q587J7 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
TDRD12Q587J7 C18orf25-203ENST00000615052 5462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.42
TDRD12Q587J7 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.42
TDRD12Q587J7 MAP3K4-202ENST00000366919 5397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
TDRD12Q587J7 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.42
TDRD12Q587J7 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TDRD12Q587J7 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TDRD12Q587J7 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TDRD12Q587J7 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TDRD12Q587J7 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TDRD12Q587J7 PCDHA4-203ENST00000530339 5251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TDRD12Q587J7 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TDRD12Q587J7 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TDRD12Q587J7 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TDRD12Q587J7 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TDRD12Q587J7 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms