Protein–RNA interactions for Protein: Q53GG5

PDLIM3, PDZ and LIM domain protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 364 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDLIM3Q53GG5 CAMKK2-201ENST00000324774 5598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PDLIM3Q53GG5 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
PDLIM3Q53GG5 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
PDLIM3Q53GG5 SYT13-201ENST00000020926 5144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PDLIM3Q53GG5 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
PDLIM3Q53GG5 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PDLIM3Q53GG5 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
PDLIM3Q53GG5 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
PDLIM3Q53GG5 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
PDLIM3Q53GG5 CTHRC1-201ENST00000330295 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PDLIM3Q53GG5 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
PDLIM3Q53GG5 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
PDLIM3Q53GG5 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
PDLIM3Q53GG5 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
PDLIM3Q53GG5 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
PDLIM3Q53GG5 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
PDLIM3Q53GG5 AC004771.3-201ENST00000574260 551 ntTSL 4 BASIC13.64□□□□□ -0.23
PDLIM3Q53GG5 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PDLIM3Q53GG5 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
PDLIM3Q53GG5 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
PDLIM3Q53GG5 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PDLIM3Q53GG5 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
PDLIM3Q53GG5 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
PDLIM3Q53GG5 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PDLIM3Q53GG5 ST6GAL2-204ENST00000409382 7275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PDLIM3Q53GG5 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
PDLIM3Q53GG5 IPO8-201ENST00000256079 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PDLIM3Q53GG5 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PDLIM3Q53GG5 TNS2-201ENST00000314250 5010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PDLIM3Q53GG5 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
PDLIM3Q53GG5 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
PDLIM3Q53GG5 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
PDLIM3Q53GG5 NPHP4-201ENST00000378156 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PDLIM3Q53GG5 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
PDLIM3Q53GG5 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PDLIM3Q53GG5 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
PDLIM3Q53GG5 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PDLIM3Q53GG5 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
PDLIM3Q53GG5 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PDLIM3Q53GG5 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PDLIM3Q53GG5 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PDLIM3Q53GG5 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PDLIM3Q53GG5 EGFR-206ENST00000454757 5464 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PDLIM3Q53GG5 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
PDLIM3Q53GG5 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PDLIM3Q53GG5 CDH23-201ENST00000224721 11139 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
PDLIM3Q53GG5 CDH23-214ENST00000622827 11122 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
PDLIM3Q53GG5 AHCYL2-202ENST00000446544 5026 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PDLIM3Q53GG5 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
PDLIM3Q53GG5 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
PDLIM3Q53GG5 SEMA4F-210ENST00000611975 6007 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
PDLIM3Q53GG5 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
PDLIM3Q53GG5 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
PDLIM3Q53GG5 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PDLIM3Q53GG5 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PDLIM3Q53GG5 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PDLIM3Q53GG5 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PDLIM3Q53GG5 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PDLIM3Q53GG5 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PDLIM3Q53GG5 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PDLIM3Q53GG5 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PDLIM3Q53GG5 LST1-202ENST00000303757 604 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PDLIM3Q53GG5 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PDLIM3Q53GG5 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
PDLIM3Q53GG5 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
PDLIM3Q53GG5 SNCA-205ENST00000394991 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PDLIM3Q53GG5 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
PDLIM3Q53GG5 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
PDLIM3Q53GG5 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
PDLIM3Q53GG5 AC022494.1-201ENST00000466044 728 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
PDLIM3Q53GG5 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
PDLIM3Q53GG5 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
PDLIM3Q53GG5 AC139713.2-206ENST00000499587 566 ntTSL 4 BASIC13.63□□□□□ -0.23
PDLIM3Q53GG5 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
PDLIM3Q53GG5 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PDLIM3Q53GG5 EEF1AKMT3-204ENST00000551420 836 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
PDLIM3Q53GG5 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
PDLIM3Q53GG5 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
PDLIM3Q53GG5 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
PDLIM3Q53GG5 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
PDLIM3Q53GG5 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
PDLIM3Q53GG5 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
PDLIM3Q53GG5 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PDLIM3Q53GG5 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PDLIM3Q53GG5 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PDLIM3Q53GG5 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PDLIM3Q53GG5 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PDLIM3Q53GG5 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PDLIM3Q53GG5 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PDLIM3Q53GG5 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
PDLIM3Q53GG5 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
PDLIM3Q53GG5 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
PDLIM3Q53GG5 ADAMTS14-201ENST00000373207 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PDLIM3Q53GG5 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PDLIM3Q53GG5 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PDLIM3Q53GG5 RPP14-202ENST00000445193 7985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PDLIM3Q53GG5 HIPK3-201ENST00000303296 7408 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
PDLIM3Q53GG5 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PDLIM3Q53GG5 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
PDLIM3Q53GG5 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
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