Protein–RNA interactions for Protein: Q53EU6

GPAT3, Glycerol-3-phosphate acyltransferase 3, humanhuman

Predictions only

Length 434 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPAT3Q53EU6 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GPAT3Q53EU6 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GPAT3Q53EU6 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GPAT3Q53EU6 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GPAT3Q53EU6 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GPAT3Q53EU6 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GPAT3Q53EU6 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GPAT3Q53EU6 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GPAT3Q53EU6 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GPAT3Q53EU6 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GPAT3Q53EU6 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GPAT3Q53EU6 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GPAT3Q53EU6 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GPAT3Q53EU6 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
GPAT3Q53EU6 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GPAT3Q53EU6 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
GPAT3Q53EU6 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
GPAT3Q53EU6 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GPAT3Q53EU6 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GPAT3Q53EU6 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GPAT3Q53EU6 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GPAT3Q53EU6 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
GPAT3Q53EU6 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GPAT3Q53EU6 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GPAT3Q53EU6 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
GPAT3Q53EU6 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GPAT3Q53EU6 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GPAT3Q53EU6 TJP2-212ENST00000636438 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GPAT3Q53EU6 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GPAT3Q53EU6 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GPAT3Q53EU6 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GPAT3Q53EU6 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GPAT3Q53EU6 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GPAT3Q53EU6 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GPAT3Q53EU6 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GPAT3Q53EU6 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GPAT3Q53EU6 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GPAT3Q53EU6 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GPAT3Q53EU6 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GPAT3Q53EU6 MIR600HG-201ENST00000449175 5984 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
GPAT3Q53EU6 AK4-202ENST00000395334 6998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GPAT3Q53EU6 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GPAT3Q53EU6 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GPAT3Q53EU6 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GPAT3Q53EU6 NBEA-208ENST00000629018 10791 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GPAT3Q53EU6 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GPAT3Q53EU6 KANK2-201ENST00000586659 5162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GPAT3Q53EU6 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GPAT3Q53EU6 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GPAT3Q53EU6 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GPAT3Q53EU6 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GPAT3Q53EU6 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GPAT3Q53EU6 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GPAT3Q53EU6 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
GPAT3Q53EU6 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GPAT3Q53EU6 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GPAT3Q53EU6 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GPAT3Q53EU6 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GPAT3Q53EU6 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
GPAT3Q53EU6 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
GPAT3Q53EU6 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GPAT3Q53EU6 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GPAT3Q53EU6 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
GPAT3Q53EU6 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GPAT3Q53EU6 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GPAT3Q53EU6 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
GPAT3Q53EU6 CEP170B-202ENST00000414716 6705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GPAT3Q53EU6 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GPAT3Q53EU6 WASHC2C-208ENST00000537517 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GPAT3Q53EU6 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GPAT3Q53EU6 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GPAT3Q53EU6 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GPAT3Q53EU6 ISPD-202ENST00000407010 5524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GPAT3Q53EU6 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GPAT3Q53EU6 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GPAT3Q53EU6 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GPAT3Q53EU6 RALGAPA1-203ENST00000389698 7864 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GPAT3Q53EU6 IMPA1-201ENST00000256108 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GPAT3Q53EU6 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GPAT3Q53EU6 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GPAT3Q53EU6 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GPAT3Q53EU6 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GPAT3Q53EU6 COL11A2-201ENST00000341947 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GPAT3Q53EU6 DAB2IP-201ENST00000259371 5469 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GPAT3Q53EU6 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GPAT3Q53EU6 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GPAT3Q53EU6 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GPAT3Q53EU6 EIF4G1-203ENST00000350481 4990 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GPAT3Q53EU6 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GPAT3Q53EU6 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GPAT3Q53EU6 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GPAT3Q53EU6 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GPAT3Q53EU6 C18orf25-203ENST00000615052 5462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GPAT3Q53EU6 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GPAT3Q53EU6 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GPAT3Q53EU6 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GPAT3Q53EU6 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GPAT3Q53EU6 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GPAT3Q53EU6 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GPAT3Q53EU6 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms