Protein–RNA interactions for Protein: Q16864

ATP6V1F, V-type proton ATPase subunit F, humanhuman

Predictions only

Length 119 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP6V1FQ16864 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
ATP6V1FQ16864 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
ATP6V1FQ16864 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
ATP6V1FQ16864 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
ATP6V1FQ16864 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
ATP6V1FQ16864 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
ATP6V1FQ16864 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
ATP6V1FQ16864 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
ATP6V1FQ16864 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
ATP6V1FQ16864 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
ATP6V1FQ16864 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
ATP6V1FQ16864 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
ATP6V1FQ16864 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
ATP6V1FQ16864 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
ATP6V1FQ16864 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
ATP6V1FQ16864 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
ATP6V1FQ16864 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
ATP6V1FQ16864 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
ATP6V1FQ16864 VWF-201ENST00000261405 8838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
ATP6V1FQ16864 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
ATP6V1FQ16864 TRPC6-206ENST00000532133 2648 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
ATP6V1FQ16864 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
ATP6V1FQ16864 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
ATP6V1FQ16864 RCOR3-203ENST00000419091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
ATP6V1FQ16864 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
ATP6V1FQ16864 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
ATP6V1FQ16864 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
ATP6V1FQ16864 NANOS1-202ENST00000425699 4017 ntAPPRIS P2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
ATP6V1FQ16864 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
ATP6V1FQ16864 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
ATP6V1FQ16864 DLGAP1-214ENST00000539435 2402 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
ATP6V1FQ16864 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
ATP6V1FQ16864 AC010931.2-202ENST00000514871 2566 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
ATP6V1FQ16864 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
ATP6V1FQ16864 USP35-203ENST00000529308 4216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
ATP6V1FQ16864 DHX36-201ENST00000308361 3487 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
ATP6V1FQ16864 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
ATP6V1FQ16864 COMP-203ENST00000542601 2707 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
ATP6V1FQ16864 KIF18B-204ENST00000593135 2745 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
ATP6V1FQ16864 DCBLD1-202ENST00000338728 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
ATP6V1FQ16864 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
ATP6V1FQ16864 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
ATP6V1FQ16864 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
ATP6V1FQ16864 OTULIN-201ENST00000284274 7800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
ATP6V1FQ16864 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
ATP6V1FQ16864 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
ATP6V1FQ16864 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
ATP6V1FQ16864 LINC01565-201ENST00000356020 2697 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
ATP6V1FQ16864 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
ATP6V1FQ16864 PHLDA1-201ENST00000266671 8069 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
ATP6V1FQ16864 HMOX2-204ENST00000414777 1752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
ATP6V1FQ16864 ENDOD1-201ENST00000278505 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
ATP6V1FQ16864 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
ATP6V1FQ16864 CICP14-201ENST00000629111 2732 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
ATP6V1FQ16864 PTPN13-203ENST00000427191 8487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
ATP6V1FQ16864 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
ATP6V1FQ16864 PRPS1-204ENST00000372435 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
ATP6V1FQ16864 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
ATP6V1FQ16864 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
ATP6V1FQ16864 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
ATP6V1FQ16864 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
ATP6V1FQ16864 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
ATP6V1FQ16864 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
ATP6V1FQ16864 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
ATP6V1FQ16864 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
ATP6V1FQ16864 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
ATP6V1FQ16864 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
ATP6V1FQ16864 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
ATP6V1FQ16864 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
ATP6V1FQ16864 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC13.1□□□□□ -0.31
ATP6V1FQ16864 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
ATP6V1FQ16864 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
ATP6V1FQ16864 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
ATP6V1FQ16864 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
ATP6V1FQ16864 COL11A2-202ENST00000361917 6104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
ATP6V1FQ16864 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
ATP6V1FQ16864 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
ATP6V1FQ16864 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
ATP6V1FQ16864 CASC3-201ENST00000264645 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
ATP6V1FQ16864 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
ATP6V1FQ16864 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
ATP6V1FQ16864 POU5F1B-201ENST00000465342 5360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
ATP6V1FQ16864 TCP10-202ENST00000397829 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
ATP6V1FQ16864 SOGA3-201ENST00000465909 3756 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
ATP6V1FQ16864 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
ATP6V1FQ16864 SSH3-203ENST00000376757 2990 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
ATP6V1FQ16864 ZFR2-201ENST00000262961 4756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
ATP6V1FQ16864 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
ATP6V1FQ16864 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
ATP6V1FQ16864 PA2G4-201ENST00000303305 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
ATP6V1FQ16864 ANKRD23-201ENST00000318357 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
ATP6V1FQ16864 UROC1-202ENST00000383579 2735 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
ATP6V1FQ16864 NACC1-201ENST00000292431 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
ATP6V1FQ16864 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
ATP6V1FQ16864 POP4-201ENST00000221770 2321 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
ATP6V1FQ16864 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
ATP6V1FQ16864 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
ATP6V1FQ16864 AC012313.3-202ENST00000599109 3322 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
ATP6V1FQ16864 GARS-201ENST00000389266 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
ATP6V1FQ16864 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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