Protein–RNA interactions for Protein: Q16658

FSCN1, Fascin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 493 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FSCN1Q16658 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
FSCN1Q16658 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
FSCN1Q16658 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
FSCN1Q16658 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
FSCN1Q16658 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
FSCN1Q16658 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
FSCN1Q16658 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
FSCN1Q16658 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
FSCN1Q16658 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
FSCN1Q16658 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
FSCN1Q16658 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
FSCN1Q16658 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
FSCN1Q16658 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
FSCN1Q16658 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
FSCN1Q16658 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
FSCN1Q16658 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
FSCN1Q16658 PHLDA2-201ENST00000314222 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
FSCN1Q16658 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
FSCN1Q16658 ZNF815P-202ENST00000422825 805 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
FSCN1Q16658 LINC00116-202ENST00000426713 461 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
FSCN1Q16658 AC099754.1-201ENST00000435884 454 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
FSCN1Q16658 KRT223P-202ENST00000449164 1292 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
FSCN1Q16658 CROCCP4-201ENST00000457096 498 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
FSCN1Q16658 RN7SL399P-201ENST00000471648 279 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
FSCN1Q16658 ROPN1-207ENST00000484329 566 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
FSCN1Q16658 RNF216P1-213ENST00000494947 946 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
FSCN1Q16658 AC084864.1-201ENST00000496217 305 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
FSCN1Q16658 AC009720.1-201ENST00000511867 586 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
FSCN1Q16658 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC17.94■□□□□ 0.46
FSCN1Q16658 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
FSCN1Q16658 PIGL-212ENST00000581006 554 ntTSL 4 BASIC17.94■□□□□ 0.46
FSCN1Q16658 YPEL2-205ENST00000585166 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
FSCN1Q16658 KXD1-204ENST00000595073 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
FSCN1Q16658 AC133552.6-201ENST00000613406 534 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
FSCN1Q16658 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
FSCN1Q16658 OXA1L-203ENST00000412791 1440 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
FSCN1Q16658 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
FSCN1Q16658 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
FSCN1Q16658 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
FSCN1Q16658 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
FSCN1Q16658 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
FSCN1Q16658 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
FSCN1Q16658 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
FSCN1Q16658 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
FSCN1Q16658 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
FSCN1Q16658 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
FSCN1Q16658 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
FSCN1Q16658 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
FSCN1Q16658 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
FSCN1Q16658 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
FSCN1Q16658 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
FSCN1Q16658 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
FSCN1Q16658 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
FSCN1Q16658 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
FSCN1Q16658 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
FSCN1Q16658 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
FSCN1Q16658 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
FSCN1Q16658 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
FSCN1Q16658 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
FSCN1Q16658 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
FSCN1Q16658 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
FSCN1Q16658 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
FSCN1Q16658 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
FSCN1Q16658 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
FSCN1Q16658 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
FSCN1Q16658 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
FSCN1Q16658 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
FSCN1Q16658 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
FSCN1Q16658 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
FSCN1Q16658 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
FSCN1Q16658 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
FSCN1Q16658 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
FSCN1Q16658 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
FSCN1Q16658 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
FSCN1Q16658 CSF2-201ENST00000296871 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
FSCN1Q16658 KCNK7-201ENST00000340313 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
FSCN1Q16658 TAGLN-202ENST00000392951 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
FSCN1Q16658 AC004987.2-201ENST00000395959 1148 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
FSCN1Q16658 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
FSCN1Q16658 ABHD11-AS1-201ENST00000427153 662 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
FSCN1Q16658 AC147067.1-201ENST00000466692 579 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
FSCN1Q16658 BRF2-202ENST00000520601 1192 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
FSCN1Q16658 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
FSCN1Q16658 AC138028.3-201ENST00000561699 213 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
FSCN1Q16658 AC079336.2-201ENST00000578408 927 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
FSCN1Q16658 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
FSCN1Q16658 NDUFS7-219ENST00000620479 754 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
FSCN1Q16658 AL033527.4-201ENST00000641026 673 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
FSCN1Q16658 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
FSCN1Q16658 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
FSCN1Q16658 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
FSCN1Q16658 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
FSCN1Q16658 EIF3K-203ENST00000545173 1327 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
FSCN1Q16658 CD81-201ENST00000263645 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
FSCN1Q16658 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
FSCN1Q16658 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
FSCN1Q16658 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
FSCN1Q16658 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
FSCN1Q16658 MRPL55-215ENST00000366742 630 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
FSCN1Q16658 LDLRAD1-201ENST00000371360 785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms